Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SnrpfP62307 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SnrpfP62307 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SnrpfP62307 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SnrpfP62307 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SnrpfP62307 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SnrpfP62307 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SnrpfP62307 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SnrpfP62307 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SnrpfP62307 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SnrpfP62307 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SnrpfP62307 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SnrpfP62307 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SnrpfP62307 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SnrpfP62307 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SnrpfP62307 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SnrpfP62307 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SnrpfP62307 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SnrpfP62307 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SnrpfP62307 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SnrpfP62307 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SnrpfP62307 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SnrpfP62307 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SnrpfP62307 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SnrpfP62307 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SnrpfP62307 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SnrpfP62307 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SnrpfP62307 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SnrpfP62307 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SnrpfP62307 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SnrpfP62307 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SnrpfP62307 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SnrpfP62307 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SnrpfP62307 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SnrpfP62307 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SnrpfP62307 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SnrpfP62307 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SnrpfP62307 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SnrpfP62307 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SnrpfP62307 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SnrpfP62307 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SnrpfP62307 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SnrpfP62307 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SnrpfP62307 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SnrpfP62307 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SnrpfP62307 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SnrpfP62307 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SnrpfP62307 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SnrpfP62307 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SnrpfP62307 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SnrpfP62307 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SnrpfP62307 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SnrpfP62307 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SnrpfP62307 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SnrpfP62307 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SnrpfP62307 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SnrpfP62307 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SnrpfP62307 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SnrpfP62307 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SnrpfP62307 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SnrpfP62307 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SnrpfP62307 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SnrpfP62307 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SnrpfP62307 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SnrpfP62307 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SnrpfP62307 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SnrpfP62307 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SnrpfP62307 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SnrpfP62307 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SnrpfP62307 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SnrpfP62307 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SnrpfP62307 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SnrpfP62307 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SnrpfP62307 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SnrpfP62307 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SnrpfP62307 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SnrpfP62307 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SnrpfP62307 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SnrpfP62307 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SnrpfP62307 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SnrpfP62307 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SnrpfP62307 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SnrpfP62307 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SnrpfP62307 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SnrpfP62307 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SnrpfP62307 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SnrpfP62307 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SnrpfP62307 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SnrpfP62307 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SnrpfP62307 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SnrpfP62307 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SnrpfP62307 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SnrpfP62307 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SnrpfP62307 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SnrpfP62307 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SnrpfP62307 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SnrpfP62307 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SnrpfP62307 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SnrpfP62307 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SnrpfP62307 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms