Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rps11P62281 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rps11P62281 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rps11P62281 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rps11P62281 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rps11P62281 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rps11P62281 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rps11P62281 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rps11P62281 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rps11P62281 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rps11P62281 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rps11P62281 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Rps11P62281 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rps11P62281 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rps11P62281 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rps11P62281 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rps11P62281 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rps11P62281 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rps11P62281 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rps11P62281 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rps11P62281 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rps11P62281 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rps11P62281 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rps11P62281 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rps11P62281 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rps11P62281 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rps11P62281 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rps11P62281 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rps11P62281 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rps11P62281 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rps11P62281 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rps11P62281 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rps11P62281 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rps11P62281 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rps11P62281 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rps11P62281 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rps11P62281 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rps11P62281 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rps11P62281 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps11P62281 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps11P62281 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps11P62281 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps11P62281 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps11P62281 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps11P62281 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rps11P62281 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rps11P62281 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rps11P62281 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rps11P62281 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps11P62281 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps11P62281 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps11P62281 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps11P62281 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps11P62281 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps11P62281 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps11P62281 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps11P62281 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps11P62281 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rps11P62281 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps11P62281 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps11P62281 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps11P62281 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps11P62281 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps11P62281 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps11P62281 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps11P62281 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps11P62281 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps11P62281 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps11P62281 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps11P62281 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps11P62281 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps11P62281 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps11P62281 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps11P62281 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps11P62281 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps11P62281 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps11P62281 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps11P62281 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps11P62281 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps11P62281 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps11P62281 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps11P62281 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps11P62281 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps11P62281 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps11P62281 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps11P62281 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps11P62281 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps11P62281 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps11P62281 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps11P62281 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps11P62281 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps11P62281 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps11P62281 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps11P62281 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps11P62281 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps11P62281 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps11P62281 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps11P62281 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps11P62281 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps11P62281 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms