Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps29P62274 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps29P62274 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps29P62274 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps29P62274 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps29P62274 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps29P62274 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps29P62274 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps29P62274 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps29P62274 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps29P62274 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps29P62274 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps29P62274 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps29P62274 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps29P62274 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps29P62274 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps29P62274 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps29P62274 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rps29P62274 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps29P62274 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rps29P62274 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps29P62274 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps29P62274 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps29P62274 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms