Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rps18P62270 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps18P62270 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps18P62270 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps18P62270 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps18P62270 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps18P62270 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps18P62270 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps18P62270 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps18P62270 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps18P62270 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps18P62270 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps18P62270 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps18P62270 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps18P62270 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps18P62270 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps18P62270 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rps18P62270 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rps18P62270 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rps18P62270 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps18P62270 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps18P62270 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps18P62270 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps18P62270 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps18P62270 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps18P62270 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps18P62270 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps18P62270 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps18P62270 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps18P62270 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps18P62270 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps18P62270 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps18P62270 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps18P62270 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps18P62270 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps18P62270 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps18P62270 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps18P62270 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps18P62270 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps18P62270 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps18P62270 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rps18P62270 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rps18P62270 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rps18P62270 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rps18P62270 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps18P62270 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps18P62270 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps18P62270 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps18P62270 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rps18P62270 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rps18P62270 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rps18P62270 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps18P62270 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps18P62270 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps18P62270 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps18P62270 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps18P62270 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rps18P62270 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rps18P62270 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rps18P62270 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rps18P62270 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rps18P62270 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rps18P62270 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rps18P62270 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rps18P62270 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps18P62270 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rps18P62270 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rps18P62270 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps18P62270 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps18P62270 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps18P62270 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps18P62270 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rps18P62270 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rps18P62270 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rps18P62270 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rps18P62270 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rps18P62270 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rps18P62270 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rps18P62270 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rps18P62270 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rps18P62270 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rps18P62270 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps18P62270 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps18P62270 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps18P62270 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps18P62270 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps18P62270 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rps18P62270 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rps18P62270 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rps18P62270 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rps18P62270 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rps18P62270 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rps18P62270 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rps18P62270 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rps18P62270 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps18P62270 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps18P62270 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps18P62270 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps18P62270 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps18P62270 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms