Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Copz1P61924 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Copz1P61924 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Copz1P61924 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Copz1P61924 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Copz1P61924 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Copz1P61924 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Copz1P61924 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Copz1P61924 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Copz1P61924 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Copz1P61924 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Copz1P61924 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Copz1P61924 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Copz1P61924 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Copz1P61924 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Copz1P61924 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Copz1P61924 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Copz1P61924 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Copz1P61924 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Copz1P61924 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Copz1P61924 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Copz1P61924 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Copz1P61924 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Copz1P61924 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copz1P61924 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copz1P61924 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copz1P61924 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copz1P61924 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copz1P61924 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Copz1P61924 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Copz1P61924 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Copz1P61924 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Copz1P61924 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Copz1P61924 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Copz1P61924 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Copz1P61924 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Copz1P61924 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Copz1P61924 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Copz1P61924 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Copz1P61924 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Copz1P61924 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copz1P61924 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copz1P61924 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copz1P61924 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copz1P61924 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copz1P61924 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copz1P61924 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copz1P61924 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copz1P61924 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copz1P61924 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copz1P61924 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copz1P61924 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Copz1P61924 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Copz1P61924 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Copz1P61924 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Copz1P61924 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Copz1P61924 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Copz1P61924 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Copz1P61924 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copz1P61924 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copz1P61924 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copz1P61924 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copz1P61924 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copz1P61924 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copz1P61924 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Copz1P61924 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Copz1P61924 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Copz1P61924 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Copz1P61924 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Copz1P61924 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Copz1P61924 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Copz1P61924 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Copz1P61924 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Copz1P61924 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Copz1P61924 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Copz1P61924 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Copz1P61924 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Copz1P61924 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Copz1P61924 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Copz1P61924 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Copz1P61924 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Copz1P61924 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Copz1P61924 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Copz1P61924 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Copz1P61924 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copz1P61924 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copz1P61924 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copz1P61924 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copz1P61924 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copz1P61924 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copz1P61924 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copz1P61924 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copz1P61924 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copz1P61924 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copz1P61924 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copz1P61924 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copz1P61924 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copz1P61924 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Copz1P61924 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Copz1P61924 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms