Protein–RNA interactions for Protein: P61073

CXCR4, C-X-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR4P61073 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR4P61073 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR4P61073 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR4P61073 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR4P61073 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR4P61073 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR4P61073 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR4P61073 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR4P61073 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR4P61073 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR4P61073 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR4P61073 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR4P61073 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR4P61073 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR4P61073 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CXCR4P61073 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCR4P61073 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCR4P61073 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCR4P61073 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCR4P61073 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCR4P61073 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR4P61073 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR4P61073 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR4P61073 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCR4P61073 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCR4P61073 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCR4P61073 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCR4P61073 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXCR4P61073 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCR4P61073 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCR4P61073 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCR4P61073 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCR4P61073 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CXCR4P61073 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXCR4P61073 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCR4P61073 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCR4P61073 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCR4P61073 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCR4P61073 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCR4P61073 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCR4P61073 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCR4P61073 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCR4P61073 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCR4P61073 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCR4P61073 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCR4P61073 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCR4P61073 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCR4P61073 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCR4P61073 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR4P61073 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR4P61073 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR4P61073 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR4P61073 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR4P61073 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR4P61073 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR4P61073 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR4P61073 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCR4P61073 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCR4P61073 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCR4P61073 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCR4P61073 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCR4P61073 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCR4P61073 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCR4P61073 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCR4P61073 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCR4P61073 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCR4P61073 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCR4P61073 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCR4P61073 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCR4P61073 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCR4P61073 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCR4P61073 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCR4P61073 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCR4P61073 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCR4P61073 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCR4P61073 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCR4P61073 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCR4P61073 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCR4P61073 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCR4P61073 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCR4P61073 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCR4P61073 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCR4P61073 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCR4P61073 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCR4P61073 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCR4P61073 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCR4P61073 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCR4P61073 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCR4P61073 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCR4P61073 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCR4P61073 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCR4P61073 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCR4P61073 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCR4P61073 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCR4P61073 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCR4P61073 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CXCR4P61073 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXCR4P61073 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXCR4P61073 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCR4P61073 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms