Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PlnP61014 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PlnP61014 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PlnP61014 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PlnP61014 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PlnP61014 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PlnP61014 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PlnP61014 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PlnP61014 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PlnP61014 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PlnP61014 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PlnP61014 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PlnP61014 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PlnP61014 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PlnP61014 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PlnP61014 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PlnP61014 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PlnP61014 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PlnP61014 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PlnP61014 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PlnP61014 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PlnP61014 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PlnP61014 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PlnP61014 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PlnP61014 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PlnP61014 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PlnP61014 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PlnP61014 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PlnP61014 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PlnP61014 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PlnP61014 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PlnP61014 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PlnP61014 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PlnP61014 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PlnP61014 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PlnP61014 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PlnP61014 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PlnP61014 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PlnP61014 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PlnP61014 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PlnP61014 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PlnP61014 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PlnP61014 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PlnP61014 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PlnP61014 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PlnP61014 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PlnP61014 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PlnP61014 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PlnP61014 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PlnP61014 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PlnP61014 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PlnP61014 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PlnP61014 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PlnP61014 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PlnP61014 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PlnP61014 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PlnP61014 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PlnP61014 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PlnP61014 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PlnP61014 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PlnP61014 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PlnP61014 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PlnP61014 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PlnP61014 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PlnP61014 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PlnP61014 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PlnP61014 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PlnP61014 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PlnP61014 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PlnP61014 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PlnP61014 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PlnP61014 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PlnP61014 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PlnP61014 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PlnP61014 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PlnP61014 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PlnP61014 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PlnP61014 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PlnP61014 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PlnP61014 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PlnP61014 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PlnP61014 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PlnP61014 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PlnP61014 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PlnP61014 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PlnP61014 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PlnP61014 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PlnP61014 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PlnP61014 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PlnP61014 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PlnP61014 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PlnP61014 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PlnP61014 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PlnP61014 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PlnP61014 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PlnP61014 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PlnP61014 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PlnP61014 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PlnP61014 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PlnP61014 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms