Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVPABLB-1P60509 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVPABLB-1P60509 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVPABLB-1P60509 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVPABLB-1P60509 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVPABLB-1P60509 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVPABLB-1P60509 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVPABLB-1P60509 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVPABLB-1P60509 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVPABLB-1P60509 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVPABLB-1P60509 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVPABLB-1P60509 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVPABLB-1P60509 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVPABLB-1P60509 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVPABLB-1P60509 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVPABLB-1P60509 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVPABLB-1P60509 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVPABLB-1P60509 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVPABLB-1P60509 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVPABLB-1P60509 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVPABLB-1P60509 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVPABLB-1P60509 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVPABLB-1P60509 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVPABLB-1P60509 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERVPABLB-1P60509 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERVPABLB-1P60509 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVPABLB-1P60509 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVPABLB-1P60509 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVPABLB-1P60509 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVPABLB-1P60509 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVPABLB-1P60509 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVPABLB-1P60509 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVPABLB-1P60509 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVPABLB-1P60509 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVPABLB-1P60509 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVPABLB-1P60509 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVPABLB-1P60509 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVPABLB-1P60509 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVPABLB-1P60509 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVPABLB-1P60509 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVPABLB-1P60509 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVPABLB-1P60509 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVPABLB-1P60509 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVPABLB-1P60509 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVPABLB-1P60509 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVPABLB-1P60509 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVPABLB-1P60509 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVPABLB-1P60509 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVPABLB-1P60509 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVPABLB-1P60509 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVPABLB-1P60509 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVPABLB-1P60509 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVPABLB-1P60509 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVPABLB-1P60509 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVPABLB-1P60509 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVPABLB-1P60509 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVPABLB-1P60509 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVPABLB-1P60509 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVPABLB-1P60509 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVPABLB-1P60509 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVPABLB-1P60509 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVPABLB-1P60509 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVPABLB-1P60509 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVPABLB-1P60509 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVPABLB-1P60509 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVPABLB-1P60509 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVPABLB-1P60509 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVPABLB-1P60509 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVPABLB-1P60509 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVPABLB-1P60509 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVPABLB-1P60509 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVPABLB-1P60509 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVPABLB-1P60509 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVPABLB-1P60509 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVPABLB-1P60509 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVPABLB-1P60509 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVPABLB-1P60509 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVPABLB-1P60509 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVPABLB-1P60509 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVPABLB-1P60509 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVPABLB-1P60509 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVPABLB-1P60509 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVPABLB-1P60509 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVPABLB-1P60509 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVPABLB-1P60509 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVPABLB-1P60509 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVPABLB-1P60509 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVPABLB-1P60509 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVPABLB-1P60509 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVPABLB-1P60509 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVPABLB-1P60509 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVPABLB-1P60509 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVPABLB-1P60509 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVPABLB-1P60509 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVPABLB-1P60509 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
ERVPABLB-1P60509 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVPABLB-1P60509 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVPABLB-1P60509 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVPABLB-1P60509 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVPABLB-1P60509 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms