Protein–RNA interactions for Protein: P60484

PTEN, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP60484 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTENP60484 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PTENP60484 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTENP60484 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTENP60484 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTENP60484 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTENP60484 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTENP60484 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTENP60484 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTENP60484 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PTENP60484 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PTENP60484 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTENP60484 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTENP60484 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTENP60484 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTENP60484 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTENP60484 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTENP60484 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTENP60484 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTENP60484 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTENP60484 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTENP60484 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTENP60484 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTENP60484 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTENP60484 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTENP60484 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTENP60484 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTENP60484 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PTENP60484 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTENP60484 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTENP60484 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTENP60484 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTENP60484 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTENP60484 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTENP60484 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTENP60484 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTENP60484 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTENP60484 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTENP60484 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTENP60484 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTENP60484 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTENP60484 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTENP60484 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTENP60484 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTENP60484 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTENP60484 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTENP60484 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTENP60484 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTENP60484 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTENP60484 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTENP60484 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTENP60484 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTENP60484 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTENP60484 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTENP60484 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTENP60484 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTENP60484 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PTENP60484 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTENP60484 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTENP60484 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTENP60484 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTENP60484 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTENP60484 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTENP60484 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTENP60484 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTENP60484 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTENP60484 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTENP60484 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTENP60484 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTENP60484 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTENP60484 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTENP60484 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTENP60484 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTENP60484 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTENP60484 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PTENP60484 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTENP60484 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTENP60484 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTENP60484 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTENP60484 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTENP60484 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTENP60484 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTENP60484 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTENP60484 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTENP60484 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTENP60484 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTENP60484 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTENP60484 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTENP60484 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTENP60484 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTENP60484 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTENP60484 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PTENP60484 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTENP60484 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTENP60484 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTENP60484 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTENP60484 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PTENP60484 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTENP60484 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTENP60484 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms