Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCCD1P59942 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCCD1P59942 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCCD1P59942 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCCD1P59942 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCCD1P59942 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCCD1P59942 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCCD1P59942 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCCD1P59942 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCCD1P59942 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCCD1P59942 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCCD1P59942 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MCCD1P59942 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCCD1P59942 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCCD1P59942 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCCD1P59942 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCCD1P59942 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCCD1P59942 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCCD1P59942 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
MCCD1P59942 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCCD1P59942 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCCD1P59942 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCCD1P59942 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MCCD1P59942 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCCD1P59942 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCCD1P59942 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
MCCD1P59942 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCCD1P59942 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCCD1P59942 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCCD1P59942 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCCD1P59942 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCCD1P59942 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCCD1P59942 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCCD1P59942 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCCD1P59942 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCCD1P59942 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCCD1P59942 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCCD1P59942 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCCD1P59942 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCCD1P59942 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MCCD1P59942 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
MCCD1P59942 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCCD1P59942 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCCD1P59942 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCCD1P59942 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCCD1P59942 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCCD1P59942 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCCD1P59942 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCCD1P59942 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCCD1P59942 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCCD1P59942 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCCD1P59942 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCCD1P59942 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCCD1P59942 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCCD1P59942 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCCD1P59942 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCCD1P59942 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MCCD1P59942 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCCD1P59942 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCCD1P59942 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCCD1P59942 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCCD1P59942 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCCD1P59942 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
MCCD1P59942 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MCCD1P59942 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MCCD1P59942 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MCCD1P59942 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MCCD1P59942 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MCCD1P59942 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MCCD1P59942 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MCCD1P59942 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCCD1P59942 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCCD1P59942 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCCD1P59942 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCCD1P59942 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCCD1P59942 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCCD1P59942 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCCD1P59942 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCCD1P59942 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCCD1P59942 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCCD1P59942 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCCD1P59942 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCCD1P59942 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCCD1P59942 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCCD1P59942 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCCD1P59942 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCCD1P59942 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MCCD1P59942 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MCCD1P59942 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MCCD1P59942 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCCD1P59942 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCCD1P59942 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCCD1P59942 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCCD1P59942 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCCD1P59942 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCCD1P59942 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCCD1P59942 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCCD1P59942 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCCD1P59942 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCCD1P59942 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms