Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00315P59091 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00315P59091 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00315P59091 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00315P59091 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00315P59091 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00315P59091 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00315P59091 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00315P59091 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00315P59091 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00315P59091 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00315P59091 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00315P59091 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00315P59091 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00315P59091 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00315P59091 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00315P59091 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00315P59091 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00315P59091 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00315P59091 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00315P59091 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00315P59091 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00315P59091 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00315P59091 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00315P59091 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00315P59091 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00315P59091 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00315P59091 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00315P59091 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00315P59091 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00315P59091 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00315P59091 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00315P59091 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00315P59091 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00315P59091 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00315P59091 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00315P59091 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00315P59091 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00315P59091 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00315P59091 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00315P59091 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00315P59091 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00315P59091 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00315P59091 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00315P59091 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00315P59091 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00315P59091 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00315P59091 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00315P59091 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00315P59091 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00315P59091 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00315P59091 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00315P59091 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00315P59091 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00315P59091 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00315P59091 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00315P59091 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00315P59091 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00315P59091 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00315P59091 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00315P59091 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00315P59091 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00315P59091 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00315P59091 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00315P59091 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00315P59091 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00315P59091 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00315P59091 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00315P59091 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00315P59091 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00315P59091 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00315P59091 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00315P59091 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00315P59091 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00315P59091 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms