Protein–RNA interactions for Protein: P58682

Tlr8, Toll-like receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr8P58682 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Tlr8P58682 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Tlr8P58682 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Tlr8P58682 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Tlr8P58682 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tlr8P58682 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tlr8P58682 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Tlr8P58682 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tlr8P58682 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Tlr8P58682 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tlr8P58682 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tlr8P58682 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tlr8P58682 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Tlr8P58682 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Tlr8P58682 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tlr8P58682 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tlr8P58682 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tlr8P58682 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tlr8P58682 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Tlr8P58682 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tlr8P58682 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tlr8P58682 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tlr8P58682 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Tlr8P58682 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tlr8P58682 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Tlr8P58682 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tlr8P58682 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tlr8P58682 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tlr8P58682 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Tlr8P58682 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Tlr8P58682 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tlr8P58682 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tlr8P58682 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tlr8P58682 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tlr8P58682 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tlr8P58682 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Tlr8P58682 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tlr8P58682 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tlr8P58682 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tlr8P58682 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tlr8P58682 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tlr8P58682 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Tlr8P58682 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Tlr8P58682 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Tlr8P58682 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Tlr8P58682 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tlr8P58682 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tlr8P58682 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tlr8P58682 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tlr8P58682 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tlr8P58682 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tlr8P58682 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tlr8P58682 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tlr8P58682 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tlr8P58682 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Tlr8P58682 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tlr8P58682 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tlr8P58682 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tlr8P58682 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Tlr8P58682 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tlr8P58682 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tlr8P58682 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tlr8P58682 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tlr8P58682 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Tlr8P58682 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tlr8P58682 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Tlr8P58682 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tlr8P58682 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tlr8P58682 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tlr8P58682 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Tlr8P58682 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tlr8P58682 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tlr8P58682 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tlr8P58682 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tlr8P58682 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Tlr8P58682 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tlr8P58682 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tlr8P58682 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tlr8P58682 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tlr8P58682 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tlr8P58682 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Tlr8P58682 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tlr8P58682 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tlr8P58682 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Tlr8P58682 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tlr8P58682 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tlr8P58682 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tlr8P58682 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tlr8P58682 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tlr8P58682 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tlr8P58682 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tlr8P58682 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tlr8P58682 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tlr8P58682 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Tlr8P58682 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tlr8P58682 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Tlr8P58682 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tlr8P58682 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tlr8P58682 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tlr8P58682 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms