Protein–RNA interactions for Protein: P57724

Pcbp4, Poly(rC)-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp4P57724 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcbp4P57724 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcbp4P57724 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcbp4P57724 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcbp4P57724 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcbp4P57724 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcbp4P57724 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcbp4P57724 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcbp4P57724 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcbp4P57724 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcbp4P57724 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcbp4P57724 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcbp4P57724 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcbp4P57724 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcbp4P57724 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcbp4P57724 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcbp4P57724 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcbp4P57724 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcbp4P57724 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcbp4P57724 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcbp4P57724 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcbp4P57724 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcbp4P57724 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcbp4P57724 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcbp4P57724 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcbp4P57724 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcbp4P57724 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcbp4P57724 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcbp4P57724 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcbp4P57724 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcbp4P57724 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcbp4P57724 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcbp4P57724 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcbp4P57724 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcbp4P57724 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcbp4P57724 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcbp4P57724 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcbp4P57724 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcbp4P57724 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcbp4P57724 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcbp4P57724 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcbp4P57724 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcbp4P57724 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcbp4P57724 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcbp4P57724 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcbp4P57724 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcbp4P57724 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcbp4P57724 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcbp4P57724 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcbp4P57724 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcbp4P57724 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcbp4P57724 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcbp4P57724 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcbp4P57724 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcbp4P57724 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcbp4P57724 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcbp4P57724 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcbp4P57724 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcbp4P57724 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcbp4P57724 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcbp4P57724 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcbp4P57724 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcbp4P57724 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcbp4P57724 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcbp4P57724 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcbp4P57724 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcbp4P57724 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcbp4P57724 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcbp4P57724 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcbp4P57724 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcbp4P57724 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcbp4P57724 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcbp4P57724 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcbp4P57724 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcbp4P57724 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcbp4P57724 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcbp4P57724 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcbp4P57724 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcbp4P57724 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcbp4P57724 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcbp4P57724 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcbp4P57724 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcbp4P57724 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcbp4P57724 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcbp4P57724 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcbp4P57724 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcbp4P57724 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcbp4P57724 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcbp4P57724 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcbp4P57724 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcbp4P57724 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcbp4P57724 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcbp4P57724 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcbp4P57724 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcbp4P57724 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcbp4P57724 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcbp4P57724 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcbp4P57724 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcbp4P57724 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcbp4P57724 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms