Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CckbrP56481 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CckbrP56481 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CckbrP56481 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CckbrP56481 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CckbrP56481 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CckbrP56481 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CckbrP56481 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CckbrP56481 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CckbrP56481 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CckbrP56481 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CckbrP56481 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CckbrP56481 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CckbrP56481 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CckbrP56481 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CckbrP56481 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CckbrP56481 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CckbrP56481 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CckbrP56481 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CckbrP56481 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CckbrP56481 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CckbrP56481 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CckbrP56481 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CckbrP56481 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CckbrP56481 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CckbrP56481 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CckbrP56481 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CckbrP56481 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CckbrP56481 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CckbrP56481 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CckbrP56481 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CckbrP56481 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CckbrP56481 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CckbrP56481 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CckbrP56481 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CckbrP56481 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CckbrP56481 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CckbrP56481 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CckbrP56481 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CckbrP56481 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CckbrP56481 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CckbrP56481 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CckbrP56481 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CckbrP56481 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CckbrP56481 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CckbrP56481 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CckbrP56481 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CckbrP56481 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CckbrP56481 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CckbrP56481 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CckbrP56481 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CckbrP56481 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CckbrP56481 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CckbrP56481 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CckbrP56481 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CckbrP56481 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CckbrP56481 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CckbrP56481 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CckbrP56481 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CckbrP56481 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CckbrP56481 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CckbrP56481 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CckbrP56481 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CckbrP56481 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CckbrP56481 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CckbrP56481 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CckbrP56481 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CckbrP56481 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CckbrP56481 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CckbrP56481 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CckbrP56481 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CckbrP56481 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CckbrP56481 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CckbrP56481 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CckbrP56481 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CckbrP56481 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CckbrP56481 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CckbrP56481 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CckbrP56481 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CckbrP56481 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CckbrP56481 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CckbrP56481 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CckbrP56481 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CckbrP56481 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CckbrP56481 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CckbrP56481 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CckbrP56481 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CckbrP56481 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CckbrP56481 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CckbrP56481 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CckbrP56481 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CckbrP56481 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CckbrP56481 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CckbrP56481 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CckbrP56481 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CckbrP56481 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CckbrP56481 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CckbrP56481 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CckbrP56481 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CckbrP56481 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms