Protein–RNA interactions for Protein: P56394

Cox17, Cytochrome c oxidase copper chaperone, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox17P56394 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cox17P56394 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cox17P56394 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cox17P56394 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cox17P56394 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cox17P56394 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cox17P56394 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cox17P56394 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cox17P56394 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cox17P56394 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cox17P56394 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cox17P56394 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cox17P56394 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cox17P56394 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cox17P56394 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cox17P56394 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cox17P56394 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cox17P56394 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cox17P56394 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cox17P56394 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cox17P56394 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cox17P56394 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cox17P56394 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cox17P56394 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cox17P56394 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cox17P56394 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cox17P56394 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cox17P56394 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cox17P56394 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cox17P56394 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cox17P56394 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cox17P56394 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cox17P56394 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cox17P56394 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cox17P56394 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cox17P56394 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cox17P56394 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cox17P56394 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cox17P56394 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cox17P56394 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cox17P56394 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cox17P56394 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cox17P56394 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cox17P56394 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cox17P56394 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cox17P56394 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cox17P56394 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox17P56394 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox17P56394 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox17P56394 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox17P56394 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cox17P56394 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cox17P56394 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cox17P56394 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cox17P56394 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cox17P56394 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cox17P56394 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cox17P56394 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cox17P56394 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cox17P56394 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cox17P56394 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cox17P56394 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cox17P56394 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cox17P56394 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cox17P56394 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cox17P56394 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cox17P56394 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cox17P56394 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cox17P56394 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cox17P56394 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cox17P56394 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cox17P56394 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cox17P56394 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cox17P56394 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cox17P56394 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cox17P56394 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cox17P56394 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cox17P56394 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cox17P56394 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cox17P56394 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cox17P56394 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cox17P56394 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cox17P56394 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cox17P56394 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cox17P56394 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cox17P56394 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cox17P56394 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cox17P56394 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cox17P56394 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cox17P56394 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cox17P56394 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cox17P56394 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cox17P56394 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cox17P56394 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cox17P56394 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cox17P56394 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cox17P56394 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cox17P56394 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cox17P56394 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cox17P56394 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms