Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAG2P55895 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAG2P55895 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAG2P55895 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAG2P55895 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAG2P55895 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAG2P55895 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAG2P55895 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAG2P55895 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RAG2P55895 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAG2P55895 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAG2P55895 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAG2P55895 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAG2P55895 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAG2P55895 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAG2P55895 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAG2P55895 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAG2P55895 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAG2P55895 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAG2P55895 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAG2P55895 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAG2P55895 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAG2P55895 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAG2P55895 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAG2P55895 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAG2P55895 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAG2P55895 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAG2P55895 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAG2P55895 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAG2P55895 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAG2P55895 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAG2P55895 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAG2P55895 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAG2P55895 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAG2P55895 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAG2P55895 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAG2P55895 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAG2P55895 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAG2P55895 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAG2P55895 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAG2P55895 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAG2P55895 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAG2P55895 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAG2P55895 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAG2P55895 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAG2P55895 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAG2P55895 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAG2P55895 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAG2P55895 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAG2P55895 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAG2P55895 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAG2P55895 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAG2P55895 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAG2P55895 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAG2P55895 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAG2P55895 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RAG2P55895 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAG2P55895 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAG2P55895 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAG2P55895 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAG2P55895 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAG2P55895 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAG2P55895 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAG2P55895 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAG2P55895 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAG2P55895 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAG2P55895 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAG2P55895 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAG2P55895 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAG2P55895 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAG2P55895 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAG2P55895 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAG2P55895 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAG2P55895 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAG2P55895 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAG2P55895 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAG2P55895 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAG2P55895 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAG2P55895 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAG2P55895 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAG2P55895 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAG2P55895 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAG2P55895 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAG2P55895 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAG2P55895 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAG2P55895 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAG2P55895 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAG2P55895 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAG2P55895 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAG2P55895 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAG2P55895 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAG2P55895 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAG2P55895 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAG2P55895 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAG2P55895 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAG2P55895 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAG2P55895 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAG2P55895 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAG2P55895 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAG2P55895 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms