Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP9P55211 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP9P55211 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP9P55211 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP9P55211 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP9P55211 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP9P55211 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP9P55211 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP9P55211 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP9P55211 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP9P55211 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP9P55211 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP9P55211 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP9P55211 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP9P55211 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP9P55211 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP9P55211 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CASP9P55211 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP9P55211 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP9P55211 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP9P55211 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP9P55211 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP9P55211 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP9P55211 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP9P55211 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP9P55211 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP9P55211 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP9P55211 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP9P55211 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP9P55211 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP9P55211 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP9P55211 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP9P55211 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP9P55211 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP9P55211 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP9P55211 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP9P55211 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP9P55211 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP9P55211 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP9P55211 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP9P55211 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP9P55211 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP9P55211 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP9P55211 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP9P55211 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP9P55211 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP9P55211 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP9P55211 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP9P55211 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CASP9P55211 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASP9P55211 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASP9P55211 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASP9P55211 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASP9P55211 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASP9P55211 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASP9P55211 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CASP9P55211 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASP9P55211 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP9P55211 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP9P55211 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP9P55211 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP9P55211 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP9P55211 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP9P55211 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP9P55211 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP9P55211 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP9P55211 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP9P55211 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CASP9P55211 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP9P55211 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP9P55211 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP9P55211 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP9P55211 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP9P55211 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP9P55211 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP9P55211 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP9P55211 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP9P55211 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP9P55211 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP9P55211 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP9P55211 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP9P55211 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP9P55211 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP9P55211 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP9P55211 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP9P55211 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP9P55211 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP9P55211 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP9P55211 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP9P55211 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP9P55211 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP9P55211 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP9P55211 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP9P55211 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASP9P55211 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASP9P55211 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CASP9P55211 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASP9P55211 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP9P55211 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP9P55211 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms