Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sh3bp1P55194 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sh3bp1P55194 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sh3bp1P55194 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sh3bp1P55194 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sh3bp1P55194 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sh3bp1P55194 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh3bp1P55194 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh3bp1P55194 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh3bp1P55194 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh3bp1P55194 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sh3bp1P55194 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sh3bp1P55194 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh3bp1P55194 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh3bp1P55194 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh3bp1P55194 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh3bp1P55194 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh3bp1P55194 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh3bp1P55194 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh3bp1P55194 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh3bp1P55194 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh3bp1P55194 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh3bp1P55194 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sh3bp1P55194 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sh3bp1P55194 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sh3bp1P55194 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sh3bp1P55194 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sh3bp1P55194 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sh3bp1P55194 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Sh3bp1P55194 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sh3bp1P55194 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sh3bp1P55194 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh3bp1P55194 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh3bp1P55194 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh3bp1P55194 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh3bp1P55194 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh3bp1P55194 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh3bp1P55194 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh3bp1P55194 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh3bp1P55194 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sh3bp1P55194 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sh3bp1P55194 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sh3bp1P55194 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sh3bp1P55194 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sh3bp1P55194 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sh3bp1P55194 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sh3bp1P55194 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sh3bp1P55194 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sh3bp1P55194 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sh3bp1P55194 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sh3bp1P55194 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sh3bp1P55194 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sh3bp1P55194 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sh3bp1P55194 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sh3bp1P55194 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sh3bp1P55194 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh3bp1P55194 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh3bp1P55194 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh3bp1P55194 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh3bp1P55194 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh3bp1P55194 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh3bp1P55194 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh3bp1P55194 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh3bp1P55194 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh3bp1P55194 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sh3bp1P55194 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sh3bp1P55194 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sh3bp1P55194 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Sh3bp1P55194 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sh3bp1P55194 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sh3bp1P55194 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sh3bp1P55194 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sh3bp1P55194 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sh3bp1P55194 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sh3bp1P55194 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sh3bp1P55194 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sh3bp1P55194 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sh3bp1P55194 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sh3bp1P55194 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sh3bp1P55194 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Sh3bp1P55194 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sh3bp1P55194 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sh3bp1P55194 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sh3bp1P55194 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sh3bp1P55194 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sh3bp1P55194 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sh3bp1P55194 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sh3bp1P55194 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sh3bp1P55194 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sh3bp1P55194 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sh3bp1P55194 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sh3bp1P55194 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sh3bp1P55194 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Sh3bp1P55194 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sh3bp1P55194 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sh3bp1P55194 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sh3bp1P55194 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sh3bp1P55194 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sh3bp1P55194 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sh3bp1P55194 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms