Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcd3P55096 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcd3P55096 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcd3P55096 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcd3P55096 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcd3P55096 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcd3P55096 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcd3P55096 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcd3P55096 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcd3P55096 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcd3P55096 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcd3P55096 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcd3P55096 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcd3P55096 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcd3P55096 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcd3P55096 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcd3P55096 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcd3P55096 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcd3P55096 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcd3P55096 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcd3P55096 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcd3P55096 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abcd3P55096 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Abcd3P55096 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abcd3P55096 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abcd3P55096 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcd3P55096 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcd3P55096 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcd3P55096 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcd3P55096 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcd3P55096 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcd3P55096 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcd3P55096 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcd3P55096 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcd3P55096 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcd3P55096 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcd3P55096 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcd3P55096 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcd3P55096 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcd3P55096 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcd3P55096 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcd3P55096 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Abcd3P55096 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Abcd3P55096 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Abcd3P55096 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Abcd3P55096 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Abcd3P55096 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Abcd3P55096 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Abcd3P55096 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Abcd3P55096 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Abcd3P55096 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Abcd3P55096 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcd3P55096 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcd3P55096 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcd3P55096 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abcd3P55096 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abcd3P55096 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Abcd3P55096 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abcd3P55096 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcd3P55096 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcd3P55096 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcd3P55096 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcd3P55096 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcd3P55096 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcd3P55096 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcd3P55096 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcd3P55096 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcd3P55096 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcd3P55096 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcd3P55096 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcd3P55096 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcd3P55096 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcd3P55096 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcd3P55096 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abcd3P55096 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abcd3P55096 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abcd3P55096 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abcd3P55096 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abcd3P55096 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abcd3P55096 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Abcd3P55096 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcd3P55096 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcd3P55096 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abcd3P55096 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abcd3P55096 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abcd3P55096 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abcd3P55096 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Abcd3P55096 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Abcd3P55096 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Abcd3P55096 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Abcd3P55096 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abcd3P55096 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abcd3P55096 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abcd3P55096 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Abcd3P55096 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abcd3P55096 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abcd3P55096 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abcd3P55096 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Abcd3P55096 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Abcd3P55096 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms