Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HADHBP55084 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HADHBP55084 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HADHBP55084 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HADHBP55084 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HADHBP55084 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HADHBP55084 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HADHBP55084 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HADHBP55084 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HADHBP55084 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HADHBP55084 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HADHBP55084 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HADHBP55084 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HADHBP55084 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HADHBP55084 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HADHBP55084 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HADHBP55084 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HADHBP55084 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
HADHBP55084 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HADHBP55084 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HADHBP55084 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HADHBP55084 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HADHBP55084 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HADHBP55084 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HADHBP55084 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HADHBP55084 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HADHBP55084 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HADHBP55084 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HADHBP55084 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HADHBP55084 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HADHBP55084 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HADHBP55084 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HADHBP55084 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HADHBP55084 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HADHBP55084 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HADHBP55084 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HADHBP55084 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HADHBP55084 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HADHBP55084 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HADHBP55084 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HADHBP55084 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HADHBP55084 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HADHBP55084 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HADHBP55084 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
HADHBP55084 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HADHBP55084 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HADHBP55084 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HADHBP55084 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HADHBP55084 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HADHBP55084 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HADHBP55084 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HADHBP55084 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HADHBP55084 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HADHBP55084 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HADHBP55084 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HADHBP55084 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HADHBP55084 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HADHBP55084 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HADHBP55084 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HADHBP55084 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HADHBP55084 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HADHBP55084 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HADHBP55084 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HADHBP55084 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HADHBP55084 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HADHBP55084 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HADHBP55084 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HADHBP55084 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HADHBP55084 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HADHBP55084 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HADHBP55084 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HADHBP55084 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HADHBP55084 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HADHBP55084 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HADHBP55084 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HADHBP55084 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HADHBP55084 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HADHBP55084 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HADHBP55084 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HADHBP55084 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HADHBP55084 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HADHBP55084 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HADHBP55084 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HADHBP55084 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HADHBP55084 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HADHBP55084 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HADHBP55084 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HADHBP55084 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HADHBP55084 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HADHBP55084 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HADHBP55084 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HADHBP55084 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HADHBP55084 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HADHBP55084 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HADHBP55084 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HADHBP55084 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HADHBP55084 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HADHBP55084 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HADHBP55084 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HADHBP55084 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms