Protein–RNA interactions for Protein: P55065

Pltp, Phospholipid transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PltpP55065 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PltpP55065 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PltpP55065 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PltpP55065 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PltpP55065 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PltpP55065 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PltpP55065 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PltpP55065 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PltpP55065 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PltpP55065 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PltpP55065 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PltpP55065 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PltpP55065 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PltpP55065 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PltpP55065 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PltpP55065 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PltpP55065 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PltpP55065 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PltpP55065 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PltpP55065 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PltpP55065 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PltpP55065 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PltpP55065 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PltpP55065 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PltpP55065 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PltpP55065 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PltpP55065 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PltpP55065 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PltpP55065 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PltpP55065 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PltpP55065 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PltpP55065 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PltpP55065 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PltpP55065 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PltpP55065 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PltpP55065 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PltpP55065 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PltpP55065 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PltpP55065 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PltpP55065 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PltpP55065 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PltpP55065 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PltpP55065 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PltpP55065 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PltpP55065 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PltpP55065 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PltpP55065 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PltpP55065 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PltpP55065 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PltpP55065 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PltpP55065 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PltpP55065 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PltpP55065 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PltpP55065 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PltpP55065 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PltpP55065 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PltpP55065 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PltpP55065 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PltpP55065 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PltpP55065 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PltpP55065 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PltpP55065 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PltpP55065 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PltpP55065 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PltpP55065 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PltpP55065 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PltpP55065 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PltpP55065 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PltpP55065 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PltpP55065 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PltpP55065 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PltpP55065 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PltpP55065 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PltpP55065 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PltpP55065 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PltpP55065 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PltpP55065 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PltpP55065 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PltpP55065 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PltpP55065 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PltpP55065 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PltpP55065 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PltpP55065 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PltpP55065 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PltpP55065 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PltpP55065 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PltpP55065 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PltpP55065 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PltpP55065 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PltpP55065 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PltpP55065 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PltpP55065 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PltpP55065 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PltpP55065 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PltpP55065 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PltpP55065 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PltpP55065 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PltpP55065 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PltpP55065 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PltpP55065 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms