Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GYS2P54840 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GYS2P54840 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GYS2P54840 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GYS2P54840 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GYS2P54840 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GYS2P54840 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GYS2P54840 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GYS2P54840 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GYS2P54840 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GYS2P54840 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GYS2P54840 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GYS2P54840 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GYS2P54840 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GYS2P54840 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GYS2P54840 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GYS2P54840 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GYS2P54840 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GYS2P54840 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GYS2P54840 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GYS2P54840 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GYS2P54840 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GYS2P54840 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GYS2P54840 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GYS2P54840 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GYS2P54840 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GYS2P54840 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GYS2P54840 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GYS2P54840 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GYS2P54840 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GYS2P54840 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GYS2P54840 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GYS2P54840 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GYS2P54840 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GYS2P54840 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GYS2P54840 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GYS2P54840 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GYS2P54840 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GYS2P54840 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GYS2P54840 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GYS2P54840 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GYS2P54840 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GYS2P54840 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GYS2P54840 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GYS2P54840 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GYS2P54840 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GYS2P54840 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GYS2P54840 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GYS2P54840 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GYS2P54840 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GYS2P54840 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GYS2P54840 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GYS2P54840 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GYS2P54840 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GYS2P54840 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GYS2P54840 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GYS2P54840 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GYS2P54840 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GYS2P54840 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GYS2P54840 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GYS2P54840 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GYS2P54840 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GYS2P54840 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GYS2P54840 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GYS2P54840 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GYS2P54840 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GYS2P54840 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GYS2P54840 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GYS2P54840 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GYS2P54840 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GYS2P54840 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GYS2P54840 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GYS2P54840 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GYS2P54840 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GYS2P54840 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GYS2P54840 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GYS2P54840 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GYS2P54840 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GYS2P54840 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GYS2P54840 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GYS2P54840 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GYS2P54840 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GYS2P54840 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GYS2P54840 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GYS2P54840 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GYS2P54840 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GYS2P54840 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GYS2P54840 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GYS2P54840 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GYS2P54840 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GYS2P54840 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GYS2P54840 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GYS2P54840 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GYS2P54840 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
GYS2P54840 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GYS2P54840 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GYS2P54840 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GYS2P54840 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GYS2P54840 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GYS2P54840 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms