Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ephb3P54754 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ephb3P54754 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ephb3P54754 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ephb3P54754 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ephb3P54754 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ephb3P54754 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ephb3P54754 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ephb3P54754 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ephb3P54754 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ephb3P54754 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ephb3P54754 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ephb3P54754 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ephb3P54754 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ephb3P54754 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ephb3P54754 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ephb3P54754 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ephb3P54754 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ephb3P54754 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ephb3P54754 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ephb3P54754 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ephb3P54754 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ephb3P54754 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ephb3P54754 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ephb3P54754 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ephb3P54754 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ephb3P54754 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ephb3P54754 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ephb3P54754 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ephb3P54754 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ephb3P54754 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ephb3P54754 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ephb3P54754 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Ephb3P54754 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ephb3P54754 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ephb3P54754 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ephb3P54754 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ephb3P54754 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ephb3P54754 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ephb3P54754 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ephb3P54754 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ephb3P54754 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ephb3P54754 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ephb3P54754 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ephb3P54754 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ephb3P54754 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ephb3P54754 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ephb3P54754 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ephb3P54754 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ephb3P54754 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ephb3P54754 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ephb3P54754 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ephb3P54754 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ephb3P54754 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ephb3P54754 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ephb3P54754 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ephb3P54754 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ephb3P54754 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ephb3P54754 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ephb3P54754 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ephb3P54754 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ephb3P54754 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ephb3P54754 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ephb3P54754 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ephb3P54754 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ephb3P54754 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ephb3P54754 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ephb3P54754 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ephb3P54754 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ephb3P54754 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ephb3P54754 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ephb3P54754 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ephb3P54754 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ephb3P54754 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ephb3P54754 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ephb3P54754 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ephb3P54754 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ephb3P54754 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ephb3P54754 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ephb3P54754 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ephb3P54754 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ephb3P54754 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ephb3P54754 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ephb3P54754 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ephb3P54754 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ephb3P54754 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ephb3P54754 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ephb3P54754 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ephb3P54754 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ephb3P54754 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ephb3P54754 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ephb3P54754 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ephb3P54754 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ephb3P54754 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ephb3P54754 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ephb3P54754 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ephb3P54754 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ephb3P54754 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ephb3P54754 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ephb3P54754 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms