Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nub1P54729 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nub1P54729 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nub1P54729 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nub1P54729 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nub1P54729 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nub1P54729 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nub1P54729 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nub1P54729 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nub1P54729 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nub1P54729 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nub1P54729 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nub1P54729 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nub1P54729 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nub1P54729 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nub1P54729 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nub1P54729 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nub1P54729 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nub1P54729 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nub1P54729 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nub1P54729 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nub1P54729 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nub1P54729 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nub1P54729 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nub1P54729 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nub1P54729 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nub1P54729 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nub1P54729 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nub1P54729 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nub1P54729 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nub1P54729 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nub1P54729 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nub1P54729 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nub1P54729 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nub1P54729 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nub1P54729 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nub1P54729 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nub1P54729 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nub1P54729 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nub1P54729 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nub1P54729 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nub1P54729 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nub1P54729 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nub1P54729 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nub1P54729 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nub1P54729 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nub1P54729 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nub1P54729 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nub1P54729 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nub1P54729 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nub1P54729 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nub1P54729 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nub1P54729 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nub1P54729 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nub1P54729 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nub1P54729 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nub1P54729 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nub1P54729 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nub1P54729 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nub1P54729 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nub1P54729 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nub1P54729 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nub1P54729 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nub1P54729 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nub1P54729 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nub1P54729 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nub1P54729 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nub1P54729 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nub1P54729 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nub1P54729 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nub1P54729 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nub1P54729 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nub1P54729 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nub1P54729 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nub1P54729 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Nub1P54729 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nub1P54729 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Nub1P54729 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Nub1P54729 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Nub1P54729 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nub1P54729 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nub1P54729 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nub1P54729 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nub1P54729 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nub1P54729 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nub1P54729 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nub1P54729 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nub1P54729 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nub1P54729 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nub1P54729 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nub1P54729 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nub1P54729 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nub1P54729 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nub1P54729 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nub1P54729 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Nub1P54729 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nub1P54729 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nub1P54729 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nub1P54729 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nub1P54729 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nub1P54729 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134 ms