Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Rad23aP54726 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rad23aP54726 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rad23aP54726 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rad23aP54726 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rad23aP54726 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rad23aP54726 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rad23aP54726 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rad23aP54726 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rad23aP54726 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rad23aP54726 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rad23aP54726 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rad23aP54726 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rad23aP54726 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rad23aP54726 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Rad23aP54726 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rad23aP54726 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rad23aP54726 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rad23aP54726 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rad23aP54726 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rad23aP54726 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rad23aP54726 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rad23aP54726 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rad23aP54726 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rad23aP54726 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rad23aP54726 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rad23aP54726 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rad23aP54726 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rad23aP54726 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rad23aP54726 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rad23aP54726 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rad23aP54726 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rad23aP54726 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rad23aP54726 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rad23aP54726 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rad23aP54726 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rad23aP54726 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rad23aP54726 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rad23aP54726 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rad23aP54726 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rad23aP54726 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rad23aP54726 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rad23aP54726 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rad23aP54726 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rad23aP54726 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rad23aP54726 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rad23aP54726 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rad23aP54726 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rad23aP54726 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rad23aP54726 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rad23aP54726 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rad23aP54726 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rad23aP54726 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rad23aP54726 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rad23aP54726 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rad23aP54726 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rad23aP54726 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rad23aP54726 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rad23aP54726 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rad23aP54726 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rad23aP54726 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rad23aP54726 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rad23aP54726 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rad23aP54726 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rad23aP54726 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rad23aP54726 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rad23aP54726 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rad23aP54726 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rad23aP54726 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rad23aP54726 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rad23aP54726 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rad23aP54726 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rad23aP54726 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad23aP54726 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad23aP54726 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad23aP54726 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad23aP54726 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad23aP54726 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rad23aP54726 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rad23aP54726 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rad23aP54726 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rad23aP54726 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rad23aP54726 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rad23aP54726 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rad23aP54726 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rad23aP54726 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rad23aP54726 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rad23aP54726 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rad23aP54726 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rad23aP54726 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad23aP54726 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad23aP54726 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad23aP54726 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rad23aP54726 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rad23aP54726 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rad23aP54726 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rad23aP54726 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rad23aP54726 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rad23aP54726 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rad23aP54726 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms