Protein–RNA interactions for Protein: P54132

BLM, Bloom syndrome protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLMP54132 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
BLMP54132 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
BLMP54132 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
BLMP54132 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
BLMP54132 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
BLMP54132 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
BLMP54132 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
BLMP54132 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
BLMP54132 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
BLMP54132 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
BLMP54132 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
BLMP54132 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
BLMP54132 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
BLMP54132 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
BLMP54132 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
BLMP54132 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
BLMP54132 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
BLMP54132 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
BLMP54132 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
BLMP54132 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
BLMP54132 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
BLMP54132 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
BLMP54132 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
BLMP54132 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
BLMP54132 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
BLMP54132 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
BLMP54132 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
BLMP54132 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
BLMP54132 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
BLMP54132 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
BLMP54132 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
BLMP54132 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
BLMP54132 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
BLMP54132 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
BLMP54132 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
BLMP54132 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
BLMP54132 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
BLMP54132 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
BLMP54132 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
BLMP54132 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
BLMP54132 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
BLMP54132 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
BLMP54132 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
BLMP54132 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
BLMP54132 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
BLMP54132 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
BLMP54132 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
BLMP54132 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
BLMP54132 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
BLMP54132 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
BLMP54132 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
BLMP54132 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
BLMP54132 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
BLMP54132 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
BLMP54132 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
BLMP54132 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
BLMP54132 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
BLMP54132 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
BLMP54132 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
BLMP54132 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
BLMP54132 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
BLMP54132 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
BLMP54132 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
BLMP54132 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
BLMP54132 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
BLMP54132 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
BLMP54132 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
BLMP54132 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
BLMP54132 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
BLMP54132 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
BLMP54132 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
BLMP54132 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
BLMP54132 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
BLMP54132 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
BLMP54132 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
BLMP54132 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
BLMP54132 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
BLMP54132 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
BLMP54132 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
BLMP54132 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
BLMP54132 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
BLMP54132 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
BLMP54132 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
BLMP54132 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
BLMP54132 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
BLMP54132 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
BLMP54132 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
BLMP54132 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
BLMP54132 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
BLMP54132 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
BLMP54132 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
BLMP54132 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
BLMP54132 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
BLMP54132 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
BLMP54132 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
BLMP54132 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
BLMP54132 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
BLMP54132 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
BLMP54132 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
BLMP54132 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms