Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.824e-14■■■■■ 66.1
SUB1P53999 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.034e-14■■■■■ 66.1
SUB1P53999 PSMB5-206ENST00000555895 444 ntTSL 310.47□□□□□ -0.732e-9■■■■■ 66
SUB1P53999 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.942e-7■■■■■ 65.8
SUB1P53999 ATP5A1-208ENST00000589252 662 ntTSL 514.47□□□□□ -0.091e-9■■■■■ 65.6
SUB1P53999 TRAPPC4-210ENST00000531290 1135 ntTSL 216.49■□□□□ 0.231e-9■■■■■ 65.6
SUB1P53999 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.721e-9■■■■■ 65.6
SUB1P53999 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.811e-9■■■■■ 65.6
SUB1P53999 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.811e-9■■■■■ 65.6
SUB1P53999 TRAPPC4-211ENST00000533012 817 ntTSL 28.74□□□□□ -1.011e-9■■■■■ 65.6
SUB1P53999 TRAPPC4-201ENST00000359005 849 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.011e-9■■■■■ 65.6
SUB1P53999 TRAPPC4-206ENST00000525303 654 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.261e-9■■■■■ 65.6
SUB1P53999 DDB1-203ENST00000451943 1224 ntTSL 26.91□□□□□ -1.31e-13■■■■■ 65.5
SUB1P53999 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.069e-40■■■■■ 65.5
SUB1P53999 TTLL12-203ENST00000484711 2451 ntTSL 212.57□□□□□ -0.49e-40■■■■■ 65.5
SUB1P53999 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.57e-8■■■■■ 65.2
SUB1P53999 CPNE3-208ENST00000614678 4201 ntTSL 1 (best)4.19□□□□□ -1.747e-8■■■■■ 65.2
SUB1P53999 GFM1-204ENST00000472383 656 ntTSL 31.76□□□□□ -2.136e-13■■■■■ 65
SUB1P53999 CLEC3B-203ENST00000490386 708 ntTSL 321.53■■□□□ 1.042e-12■■■■■ 65
SUB1P53999 EXOSC7-209ENST00000486727 1647 ntTSL 28.35□□□□□ -1.072e-12■■■■■ 65
SUB1P53999 EXOSC7-202ENST00000459856 434 ntTSL 36.08□□□□□ -1.442e-12■■■■■ 65
SUB1P53999 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.142e-11■■■■■ 65
SUB1P53999 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.472e-11■■■■■ 65
SUB1P53999 SNX2-206ENST00000507321 484 ntTSL 23.53□□□□□ -1.842e-11■■■■■ 65
SUB1P53999 SNX2-209ENST00000510372 1412 ntTSL 23.06□□□□□ -1.922e-11■■■■■ 65
SUB1P53999 SNX2-204ENST00000506847 798 ntTSL 52.6□□□□□ -1.992e-11■■■■■ 65
SUB1P53999 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.264e-31■■■■■ 65
SUB1P53999 DAZAP2-203ENST00000436900 1811 ntTSL 59.06□□□□□ -0.964e-31■■■■■ 65
SUB1P53999 DAZAP2-205ENST00000449723 2098 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.974e-31■■■■■ 65
SUB1P53999 DAZAP2-214ENST00000552459 3664 ntTSL 28.99□□□□□ -0.974e-31■■■■■ 65
SUB1P53999 DAZAP2-215ENST00000604900 1045 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.084e-31■■■■■ 65
SUB1P53999 DAZAP2-202ENST00000425012 1117 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.44e-31■■■■■ 65
SUB1P53999 MYL12A-207ENST00000579226 947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.081e-7■■■■■ 65
SUB1P53999 MYL12A-206ENST00000578611 1004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.261e-7■■■■■ 65
SUB1P53999 MYL12A-201ENST00000217652 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.311e-7■■■■■ 65
SUB1P53999 MYL12A-204ENST00000578038 463 ntTSL 33.7□□□□□ -1.821e-7■■■■■ 65
SUB1P53999 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.081e-7■■■■■ 65
SUB1P53999 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.081e-7■■■■■ 65
SUB1P53999 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.486e-11■■■■■ 64.8
SUB1P53999 NONO-203ENST00000373856 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.794e-77■■■■■ 64.7
SUB1P53999 NONO-211ENST00000473525 1430 ntTSL 58.57□□□□□ -1.044e-77■■■■■ 64.7
SUB1P53999 NONO-212ENST00000474431 644 ntTSL 55.69□□□□□ -1.54e-77■■■■■ 64.7
SUB1P53999 NONO-210ENST00000472185 397 ntTSL 54.61□□□□□ -1.674e-77■■■■■ 64.7
SUB1P53999 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.872e-15■■■■■ 64.6
SUB1P53999 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.731e-45■■■■■ 64.4
SUB1P53999 AMFR-208ENST00000566757 1844 nt12.73□□□□□ -0.371e-9■■■■■ 64.4
SUB1P53999 AMFR-210ENST00000568325 1230 ntTSL 210.1□□□□□ -0.791e-9■■■■■ 64.4
SUB1P53999 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.115e-10■■■■■ 64.4
SUB1P53999 UBE2B-203ENST00000503080 657 ntTSL 22.2□□□□□ -2.065e-10■■■■■ 64.4
SUB1P53999 UBE2B-202ENST00000499038 682 ntTSL 31.55□□□□□ -2.165e-10■■■■■ 64.4
SUB1P53999 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.121e-13■■■■■ 63.9
SUB1P53999 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.511e-13■■■■■ 63.9
SUB1P53999 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.32e-13■■■■■ 63.9
SUB1P53999 ACSS2-211ENST00000477932 2450 ntTSL 516.24■□□□□ 0.197e-10■■■■■ 63.8
SUB1P53999 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.127e-10■■■■■ 63.8
SUB1P53999 ACSS2-210ENST00000476922 1527 ntTSL 213.69□□□□□ -0.227e-10■■■■■ 63.8
SUB1P53999 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.467e-10■■■■■ 63.8
SUB1P53999 ACSS2-214ENST00000481284 2851 ntTSL 27.77□□□□□ -1.177e-10■■■■■ 63.8
SUB1P53999 RPL9-207ENST00000506581 371 ntTSL 52.21□□□□□ -2.062e-10■■■■■ 63.8
SUB1P53999 SLC25A13-202ENST00000416240 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.757e-9■■■■■ 63.8
SUB1P53999 SLC25A13-201ENST00000265631 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.227e-9■■■■■ 63.8
SUB1P53999 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.58e-17■■■■■ 63.8
SUB1P53999 ATP5F1-201ENST00000369721 1040 ntTSL 25.9□□□□□ -1.468e-17■■■■■ 63.8
SUB1P53999 ATP5F1-204ENST00000468818 859 ntTSL 33.37□□□□□ -1.878e-17■■■■■ 63.8
SUB1P53999 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.561e-13■■■■■ 63.7
SUB1P53999 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.381e-13■■■■■ 63.7
SUB1P53999 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.651e-13■■■■■ 63.7
SUB1P53999 CAPN2-202ENST00000433674 3264 ntTSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.11e-13■■■■■ 63.7
SUB1P53999 CAPN2-209ENST00000487223 2991 ntTSL 24.58□□□□□ -1.681e-13■■■■■ 63.7
SUB1P53999 GALNT12-202ENST00000470473 772 ntTSL 24.3□□□□□ -1.721e-13■■■■■ 63.7
SUB1P53999 CAPN2-206ENST00000474026 4130 ntTSL 23.94□□□□□ -1.781e-13■■■■■ 63.7
SUB1P53999 CAPN2-204ENST00000463997 2547 ntTSL 23.71□□□□□ -1.821e-13■■■■■ 63.7
SUB1P53999 CWC27-205ENST00000545000 881 ntTSL 22.61□□□□□ -1.991e-13■■■■■ 63.7
SUB1P53999 ADH5-201ENST00000296412 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.285e-7■■■■■ 63.4
SUB1P53999 FUS-209ENST00000566605 1787 ntTSL 1 (best)20.82■□□□□ 0.925e-7■■■■■ 63.3
SUB1P53999 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.725e-7■■■■■ 63.3
SUB1P53999 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.365e-7■■■■■ 63.3
SUB1P53999 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.135e-7■■■■■ 63.3
SUB1P53999 FUS-206ENST00000487509 4920 ntTSL 212.53□□□□□ -0.45e-7■■■■■ 63.3
SUB1P53999 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.452e-15■■■■■ 63.1
SUB1P53999 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.552e-15■■■■■ 63.1
SUB1P53999 ATP6V1H-207ENST00000520188 1967 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.852e-15■■■■■ 63.1
SUB1P53999 ATP6V1H-203ENST00000396774 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.92e-15■■■■■ 63.1
SUB1P53999 ATP6V1H-215ENST00000523343 467 ntTSL 36.3□□□□□ -1.42e-15■■■■■ 63.1
SUB1P53999 ATP6V1H-204ENST00000518072 494 ntTSL 25.79□□□□□ -1.482e-15■■■■■ 63.1
SUB1P53999 ATP6V1H-217ENST00000523899 527 ntTSL 35.54□□□□□ -1.522e-15■■■■■ 63.1
SUB1P53999 ATP6V1H-213ENST00000522159 423 ntTSL 31.75□□□□□ -2.132e-15■■■■■ 63.1
SUB1P53999 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.216e-9■■■■■ 63.1
SUB1P53999 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.146e-9■■■■■ 63.1
SUB1P53999 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.086e-9■■■■■ 63.1
SUB1P53999 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.346e-9■■■■■ 63.1
SUB1P53999 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.346e-9■■■■■ 63.1
SUB1P53999 AP2S1-209ENST00000601498 898 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.846e-9■■■■■ 63.1
SUB1P53999 PRDX1-206ENST00000483583 530 ntTSL 216.75■□□□□ 0.272e-51■■■■■ 62.9
SUB1P53999 PRDX1-204ENST00000424390 795 ntTSL 210.53□□□□□ -0.722e-51■■■■■ 62.9
SUB1P53999 PRDX1-205ENST00000447184 606 ntTSL 56.32□□□□□ -1.42e-51■■■■■ 62.9
SUB1P53999 PSMA6-205ENST00000554457 4730 nt6.37□□□□□ -1.391e-7■■■■■ 62.9
SUB1P53999 PSMA6-213ENST00000556221 423 ntTSL 31.59□□□□□ -2.151e-7■■■■■ 62.9
SUB1P53999 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.212e-13■■■■■ 62.7
SUB1P53999 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.282e-13■■■■■ 62.7
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