Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PctpP53808 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PctpP53808 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PctpP53808 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PctpP53808 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PctpP53808 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PctpP53808 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PctpP53808 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PctpP53808 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PctpP53808 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PctpP53808 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PctpP53808 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PctpP53808 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PctpP53808 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PctpP53808 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PctpP53808 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PctpP53808 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PctpP53808 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PctpP53808 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PctpP53808 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PctpP53808 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PctpP53808 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PctpP53808 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PctpP53808 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PctpP53808 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PctpP53808 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PctpP53808 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PctpP53808 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PctpP53808 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PctpP53808 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PctpP53808 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PctpP53808 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PctpP53808 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PctpP53808 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PctpP53808 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PctpP53808 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PctpP53808 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PctpP53808 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PctpP53808 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PctpP53808 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PctpP53808 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PctpP53808 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PctpP53808 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PctpP53808 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PctpP53808 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PctpP53808 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PctpP53808 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PctpP53808 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PctpP53808 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PctpP53808 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PctpP53808 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PctpP53808 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PctpP53808 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PctpP53808 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PctpP53808 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PctpP53808 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PctpP53808 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PctpP53808 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PctpP53808 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PctpP53808 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PctpP53808 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PctpP53808 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PctpP53808 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PctpP53808 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PctpP53808 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PctpP53808 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PctpP53808 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PctpP53808 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PctpP53808 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PctpP53808 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PctpP53808 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PctpP53808 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PctpP53808 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PctpP53808 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PctpP53808 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PctpP53808 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PctpP53808 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PctpP53808 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PctpP53808 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PctpP53808 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PctpP53808 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PctpP53808 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PctpP53808 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PctpP53808 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PctpP53808 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PctpP53808 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PctpP53808 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PctpP53808 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PctpP53808 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PctpP53808 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PctpP53808 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PctpP53808 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PctpP53808 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PctpP53808 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PctpP53808 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PctpP53808 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PctpP53808 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PctpP53808 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PctpP53808 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PctpP53808 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113 ms