Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRYBA4P53673 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRYBA4P53673 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRYBA4P53673 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRYBA4P53673 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRYBA4P53673 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRYBA4P53673 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRYBA4P53673 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRYBA4P53673 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRYBA4P53673 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRYBA4P53673 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRYBA4P53673 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRYBA4P53673 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CRYBA4P53673 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRYBA4P53673 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRYBA4P53673 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRYBA4P53673 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRYBA4P53673 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRYBA4P53673 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CRYBA4P53673 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CRYBA4P53673 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRYBA4P53673 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRYBA4P53673 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRYBA4P53673 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRYBA4P53673 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CRYBA4P53673 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRYBA4P53673 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CRYBA4P53673 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRYBA4P53673 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRYBA4P53673 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRYBA4P53673 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CRYBA4P53673 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CRYBA4P53673 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRYBA4P53673 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRYBA4P53673 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRYBA4P53673 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRYBA4P53673 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRYBA4P53673 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRYBA4P53673 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRYBA4P53673 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRYBA4P53673 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRYBA4P53673 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRYBA4P53673 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRYBA4P53673 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRYBA4P53673 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRYBA4P53673 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRYBA4P53673 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRYBA4P53673 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRYBA4P53673 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRYBA4P53673 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRYBA4P53673 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRYBA4P53673 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRYBA4P53673 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRYBA4P53673 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRYBA4P53673 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRYBA4P53673 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRYBA4P53673 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CRYBA4P53673 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRYBA4P53673 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRYBA4P53673 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CRYBA4P53673 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRYBA4P53673 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRYBA4P53673 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRYBA4P53673 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRYBA4P53673 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRYBA4P53673 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CRYBA4P53673 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRYBA4P53673 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRYBA4P53673 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRYBA4P53673 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CRYBA4P53673 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRYBA4P53673 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRYBA4P53673 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRYBA4P53673 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRYBA4P53673 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRYBA4P53673 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRYBA4P53673 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRYBA4P53673 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRYBA4P53673 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRYBA4P53673 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRYBA4P53673 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRYBA4P53673 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CRYBA4P53673 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRYBA4P53673 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRYBA4P53673 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRYBA4P53673 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CRYBA4P53673 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRYBA4P53673 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRYBA4P53673 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CRYBA4P53673 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRYBA4P53673 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRYBA4P53673 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRYBA4P53673 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRYBA4P53673 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRYBA4P53673 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRYBA4P53673 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRYBA4P53673 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRYBA4P53673 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRYBA4P53673 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRYBA4P53673 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms