Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RABGGTBP53611 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RABGGTBP53611 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RABGGTBP53611 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RABGGTBP53611 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RABGGTBP53611 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RABGGTBP53611 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RABGGTBP53611 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RABGGTBP53611 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RABGGTBP53611 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RABGGTBP53611 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RABGGTBP53611 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RABGGTBP53611 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RABGGTBP53611 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RABGGTBP53611 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RABGGTBP53611 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RABGGTBP53611 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RABGGTBP53611 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RABGGTBP53611 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RABGGTBP53611 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RABGGTBP53611 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RABGGTBP53611 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RABGGTBP53611 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RABGGTBP53611 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RABGGTBP53611 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RABGGTBP53611 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RABGGTBP53611 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RABGGTBP53611 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RABGGTBP53611 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RABGGTBP53611 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RABGGTBP53611 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RABGGTBP53611 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
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RABGGTBP53611 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
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RABGGTBP53611 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
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RABGGTBP53611 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RABGGTBP53611 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
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