Protein–RNA interactions for Protein: P53437

RRN9, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN9, yeastyeast

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN9P53437 YBR232CYBR232C 360 nt7.41□□□□□ -1.22
RRN9P53437 Q0010Q0010 387 nt7.41□□□□□ -1.22
RRN9P53437 LYS20YDL182W 1287 nt7.4□□□□□ -1.22
RRN9P53437 PUS7YOR243C 2031 nt7.39□□□□□ -1.23
RRN9P53437 NDE2YDL085W 1638 nt7.38□□□□□ -1.23
RRN9P53437 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt7.38□□□□□ -1.23
RRN9P53437 PMT7YDR307W 1989 nt7.37□□□□□ -1.23
RRN9P53437 STF1YDL130W-A 261 nt7.36□□□□□ -1.23
RRN9P53437 YFR020WYFR020W 699 nt7.36□□□□□ -1.23
RRN9P53437 YBR056WYBR056W 1506 nt7.36□□□□□ -1.23
RRN9P53437 TIF3YPR163C 1311 nt7.35□□□□□ -1.23
RRN9P53437 MOB1YIL106W 945 nt7.35□□□□□ -1.23
RRN9P53437 YNL140CYNL140C 570 nt7.35□□□□□ -1.23
RRN9P53437 ENO1YGR254W 1314 nt7.34□□□□□ -1.23
RRN9P53437 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt7.34□□□□□ -1.23
RRN9P53437 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt7.34□□□□□ -1.23
RRN9P53437 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt7.34□□□□□ -1.23
RRN9P53437 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt7.34□□□□□ -1.23
RRN9P53437 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt7.34□□□□□ -1.23
RRN9P53437 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt7.34□□□□□ -1.23
RRN9P53437 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt7.34□□□□□ -1.23
RRN9P53437 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt7.34□□□□□ -1.23
RRN9P53437 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt7.34□□□□□ -1.23
RRN9P53437 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt7.34□□□□□ -1.23
RRN9P53437 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt7.34□□□□□ -1.23
RRN9P53437 MEP1YGR121C 1479 nt7.34□□□□□ -1.23
RRN9P53437 YJL045WYJL045W 1905 nt7.33□□□□□ -1.24
RRN9P53437 FLX1YIL134W 936 nt7.33□□□□□ -1.24
RRN9P53437 RSM7YJR113C 744 nt7.33□□□□□ -1.24
RRN9P53437 YJR149WYJR149W 1215 nt7.32□□□□□ -1.24
RRN9P53437 AIM34YMR003W 597 nt7.32□□□□□ -1.24
RRN9P53437 IPL1YPL209C 1104 nt7.32□□□□□ -1.24
RRN9P53437 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.31□□□□□ -1.24
RRN9P53437 YIR035CYIR035C 765 nt7.31□□□□□ -1.24
RRN9P53437 BUB2YMR055C 921 nt7.31□□□□□ -1.24
RRN9P53437 GLY1YEL046C 1164 nt7.3□□□□□ -1.24
RRN9P53437 INO1YJL153C 1602 nt7.3□□□□□ -1.24
RRN9P53437 GUT1YHL032C 2130 nt7.3□□□□□ -1.24
RRN9P53437 MRN1YPL184C 1839 nt7.29□□□□□ -1.24
RRN9P53437 BUD31YCR063W 474 nt7.29□□□□□ -1.24
RRN9P53437 INM1YHR046C 888 nt7.29□□□□□ -1.24
RRN9P53437 NME1NME1 340 nt7.29□□□□□ -1.24
RRN9P53437 PMA2YPL036W 2844 nt7.28□□□□□ -1.24
RRN9P53437 ITR1YDR497C 1755 nt7.28□□□□□ -1.24
RRN9P53437 TGL5YOR081C 2250 nt7.27□□□□□ -1.24
RRN9P53437 YJR154WYJR154W 1041 nt7.27□□□□□ -1.25
RRN9P53437 CYC3YAL039C 810 nt7.27□□□□□ -1.25
RRN9P53437 YPL264CYPL264C 1062 nt7.27□□□□□ -1.25
RRN9P53437 PRC1YMR297W 1599 nt7.26□□□□□ -1.25
RRN9P53437 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.26□□□□□ -1.25
RRN9P53437 SRP102YKL154W 735 nt7.26□□□□□ -1.25
RRN9P53437 WSC4YHL028W 1818 nt7.26□□□□□ -1.25
RRN9P53437 FRT1YOR324C 1809 nt7.26□□□□□ -1.25
RRN9P53437 MET13YGL125W 1803 nt7.25□□□□□ -1.25
RRN9P53437 TDA4YJR116W 840 nt7.25□□□□□ -1.25
RRN9P53437 YLR280CYLR280C 351 nt7.25□□□□□ -1.25
RRN9P53437 LRO1YNR008W 1986 nt7.25□□□□□ -1.25
RRN9P53437 RNA170RNA170 169 nt7.24□□□□□ -1.25
RRN9P53437 TOP3YLR234W 1971 nt7.24□□□□□ -1.25
RRN9P53437 BEM1YBR200W 1656 nt7.23□□□□□ -1.25
RRN9P53437 YJL064WYJL064W 396 nt7.23□□□□□ -1.25
RRN9P53437 SEN2YLR105C 1134 nt7.23□□□□□ -1.25
RRN9P53437 MET22YOL064C 1074 nt7.23□□□□□ -1.25
RRN9P53437 NDE1YMR145C 1683 nt7.22□□□□□ -1.25
RRN9P53437 HXT9YJL219W 1704 nt7.22□□□□□ -1.25
RRN9P53437 SPE4YLR146C 903 nt7.22□□□□□ -1.25
RRN9P53437 YLR460CYLR460C 1131 nt7.22□□□□□ -1.25
RRN9P53437 ERO1YML130C 1692 nt7.22□□□□□ -1.25
RRN9P53437 KTR4YBR199W 1395 nt7.21□□□□□ -1.25
RRN9P53437 CHA1YCL064C 1083 nt7.21□□□□□ -1.26
RRN9P53437 RRT6YGL146C 936 nt7.21□□□□□ -1.26
RRN9P53437 DIP5YPL265W 1827 nt7.2□□□□□ -1.26
RRN9P53437 YCR025CYCR025C 411 nt7.2□□□□□ -1.26
RRN9P53437 CHS7YHR142W 951 nt7.2□□□□□ -1.26
RRN9P53437 SGF73YGL066W 1974 nt7.2□□□□□ -1.26
RRN9P53437 YER152CYER152C 1332 nt7.2□□□□□ -1.26
RRN9P53437 EHT1YBR177C 1356 nt7.2□□□□□ -1.26
RRN9P53437 SER2YGR208W 930 nt7.19□□□□□ -1.26
RRN9P53437 GGC1YDL198C 903 nt7.18□□□□□ -1.26
RRN9P53437 ATP10YLR393W 840 nt7.18□□□□□ -1.26
RRN9P53437 PAU19YMR325W 375 nt7.18□□□□□ -1.26
RRN9P53437 PDC6YGR087C 1692 nt7.18□□□□□ -1.26
RRN9P53437 CCR4YAL021C 2514 nt7.18□□□□□ -1.26
RRN9P53437 MRP7YNL005C 1116 nt7.17□□□□□ -1.26
RRN9P53437 OLA1YBR025C 1185 nt7.17□□□□□ -1.26
RRN9P53437 RSC9YML127W 1746 nt7.16□□□□□ -1.26
RRN9P53437 YGR210CYGR210C 1236 nt7.16□□□□□ -1.26
RRN9P53437 ERG6YML008C 1152 nt7.16□□□□□ -1.26
RRN9P53437 OCH1YGL038C 1443 nt7.16□□□□□ -1.26
RRN9P53437 YMR166CYMR166C 1107 nt7.15□□□□□ -1.26
RRN9P53437 HTS1YPR033C 1641 nt7.15□□□□□ -1.27
RRN9P53437 YGR137WYGR137W 375 nt7.14□□□□□ -1.27
RRN9P53437 WSC3YOL105C 1671 nt7.14□□□□□ -1.27
RRN9P53437 PMT1YDL095W 2454 nt7.13□□□□□ -1.27
RRN9P53437 ERR3YMR323W 1314 nt7.13□□□□□ -1.27
RRN9P53437 ERR1YOR393W 1314 nt7.13□□□□□ -1.27
RRN9P53437 ERR2YPL281C 1314 nt7.13□□□□□ -1.27
RRN9P53437 CAK1YFL029C 1107 nt7.13□□□□□ -1.27
RRN9P53437 RCF1YML030W 480 nt7.13□□□□□ -1.27
RRN9P53437 CTF3YLR381W 2202 nt7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.1 ms