Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBX2P52951 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBX2P52951 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBX2P52951 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBX2P52951 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBX2P52951 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBX2P52951 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBX2P52951 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBX2P52951 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBX2P52951 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBX2P52951 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBX2P52951 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBX2P52951 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBX2P52951 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBX2P52951 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBX2P52951 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBX2P52951 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBX2P52951 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBX2P52951 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBX2P52951 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBX2P52951 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBX2P52951 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBX2P52951 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBX2P52951 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBX2P52951 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBX2P52951 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBX2P52951 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBX2P52951 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBX2P52951 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GBX2P52951 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GBX2P52951 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBX2P52951 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBX2P52951 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBX2P52951 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBX2P52951 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBX2P52951 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GBX2P52951 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBX2P52951 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBX2P52951 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBX2P52951 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBX2P52951 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GBX2P52951 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBX2P52951 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBX2P52951 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBX2P52951 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBX2P52951 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBX2P52951 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBX2P52951 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBX2P52951 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBX2P52951 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBX2P52951 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBX2P52951 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBX2P52951 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBX2P52951 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBX2P52951 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBX2P52951 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBX2P52951 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBX2P52951 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBX2P52951 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GBX2P52951 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GBX2P52951 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GBX2P52951 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GBX2P52951 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBX2P52951 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBX2P52951 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBX2P52951 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GBX2P52951 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBX2P52951 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBX2P52951 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBX2P52951 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBX2P52951 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBX2P52951 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBX2P52951 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBX2P52951 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBX2P52951 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GBX2P52951 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBX2P52951 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBX2P52951 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBX2P52951 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBX2P52951 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBX2P52951 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBX2P52951 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBX2P52951 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBX2P52951 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBX2P52951 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBX2P52951 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBX2P52951 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBX2P52951 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBX2P52951 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GBX2P52951 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBX2P52951 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBX2P52951 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBX2P52951 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBX2P52951 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBX2P52951 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBX2P52951 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBX2P52951 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBX2P52951 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBX2P52951 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBX2P52951 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms