Protein–RNA interactions for Protein: P52850

Ndst2, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst2P52850 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndst2P52850 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndst2P52850 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndst2P52850 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndst2P52850 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndst2P52850 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndst2P52850 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndst2P52850 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ndst2P52850 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ndst2P52850 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ndst2P52850 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ndst2P52850 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndst2P52850 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndst2P52850 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndst2P52850 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ndst2P52850 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ndst2P52850 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ndst2P52850 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ndst2P52850 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ndst2P52850 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ndst2P52850 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ndst2P52850 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ndst2P52850 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ndst2P52850 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndst2P52850 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndst2P52850 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndst2P52850 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndst2P52850 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ndst2P52850 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ndst2P52850 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ndst2P52850 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ndst2P52850 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ndst2P52850 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ndst2P52850 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ndst2P52850 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ndst2P52850 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ndst2P52850 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ndst2P52850 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ndst2P52850 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ndst2P52850 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ndst2P52850 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ndst2P52850 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ndst2P52850 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ndst2P52850 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ndst2P52850 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ndst2P52850 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ndst2P52850 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ndst2P52850 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ndst2P52850 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ndst2P52850 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ndst2P52850 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ndst2P52850 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ndst2P52850 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ndst2P52850 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ndst2P52850 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ndst2P52850 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ndst2P52850 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ndst2P52850 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndst2P52850 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndst2P52850 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndst2P52850 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndst2P52850 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndst2P52850 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndst2P52850 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ndst2P52850 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ndst2P52850 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ndst2P52850 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ndst2P52850 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ndst2P52850 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ndst2P52850 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ndst2P52850 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ndst2P52850 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ndst2P52850 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ndst2P52850 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ndst2P52850 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ndst2P52850 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ndst2P52850 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ndst2P52850 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ndst2P52850 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ndst2P52850 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ndst2P52850 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ndst2P52850 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ndst2P52850 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ndst2P52850 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ndst2P52850 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ndst2P52850 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ndst2P52850 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ndst2P52850 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ndst2P52850 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ndst2P52850 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ndst2P52850 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ndst2P52850 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ndst2P52850 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ndst2P52850 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ndst2P52850 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ndst2P52850 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ndst2P52850 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ndst2P52850 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndst2P52850 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndst2P52850 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms