Protein–RNA interactions for Protein: P52803

EFNA5, Ephrin-A5, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA5P52803 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EFNA5P52803 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EFNA5P52803 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EFNA5P52803 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EFNA5P52803 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EFNA5P52803 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EFNA5P52803 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
EFNA5P52803 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EFNA5P52803 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EFNA5P52803 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EFNA5P52803 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EFNA5P52803 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
EFNA5P52803 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
EFNA5P52803 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EFNA5P52803 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EFNA5P52803 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EFNA5P52803 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EFNA5P52803 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EFNA5P52803 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EFNA5P52803 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EFNA5P52803 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
EFNA5P52803 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EFNA5P52803 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
EFNA5P52803 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EFNA5P52803 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EFNA5P52803 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EFNA5P52803 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EFNA5P52803 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EFNA5P52803 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EFNA5P52803 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EFNA5P52803 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EFNA5P52803 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
EFNA5P52803 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EFNA5P52803 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EFNA5P52803 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EFNA5P52803 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EFNA5P52803 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EFNA5P52803 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EFNA5P52803 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EFNA5P52803 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EFNA5P52803 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EFNA5P52803 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EFNA5P52803 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EFNA5P52803 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EFNA5P52803 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EFNA5P52803 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFNA5P52803 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFNA5P52803 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFNA5P52803 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EFNA5P52803 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EFNA5P52803 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EFNA5P52803 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EFNA5P52803 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFNA5P52803 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFNA5P52803 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EFNA5P52803 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EFNA5P52803 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EFNA5P52803 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EFNA5P52803 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EFNA5P52803 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EFNA5P52803 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
EFNA5P52803 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFNA5P52803 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFNA5P52803 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFNA5P52803 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFNA5P52803 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
EFNA5P52803 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFNA5P52803 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFNA5P52803 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFNA5P52803 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFNA5P52803 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFNA5P52803 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFNA5P52803 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFNA5P52803 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFNA5P52803 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFNA5P52803 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFNA5P52803 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
EFNA5P52803 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFNA5P52803 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFNA5P52803 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFNA5P52803 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFNA5P52803 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFNA5P52803 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28■■■□□ 2.07
EFNA5P52803 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFNA5P52803 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFNA5P52803 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFNA5P52803 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFNA5P52803 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EFNA5P52803 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28■■■□□ 2.07
EFNA5P52803 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFNA5P52803 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFNA5P52803 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EFNA5P52803 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFNA5P52803 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFNA5P52803 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFNA5P52803 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFNA5P52803 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EFNA5P52803 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EFNA5P52803 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EFNA5P52803 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms