Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF135P52742 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF135P52742 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF135P52742 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF135P52742 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF135P52742 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF135P52742 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF135P52742 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF135P52742 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF135P52742 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF135P52742 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF135P52742 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF135P52742 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF135P52742 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF135P52742 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF135P52742 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF135P52742 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF135P52742 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZNF135P52742 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZNF135P52742 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF135P52742 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF135P52742 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF135P52742 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF135P52742 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF135P52742 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF135P52742 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF135P52742 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF135P52742 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF135P52742 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF135P52742 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF135P52742 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF135P52742 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF135P52742 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF135P52742 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF135P52742 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF135P52742 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF135P52742 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF135P52742 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF135P52742 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF135P52742 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF135P52742 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF135P52742 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF135P52742 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF135P52742 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF135P52742 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF135P52742 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF135P52742 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF135P52742 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF135P52742 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF135P52742 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF135P52742 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF135P52742 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF135P52742 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF135P52742 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF135P52742 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF135P52742 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF135P52742 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF135P52742 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF135P52742 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF135P52742 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF135P52742 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF135P52742 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF135P52742 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF135P52742 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF135P52742 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF135P52742 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF135P52742 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF135P52742 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF135P52742 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF135P52742 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF135P52742 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF135P52742 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF135P52742 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF135P52742 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF135P52742 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF135P52742 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF135P52742 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF135P52742 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF135P52742 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF135P52742 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
ZNF135P52742 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF135P52742 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF135P52742 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF135P52742 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF135P52742 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF135P52742 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF135P52742 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF135P52742 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF135P52742 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF135P52742 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF135P52742 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF135P52742 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF135P52742 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF135P52742 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF135P52742 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF135P52742 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF135P52742 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF135P52742 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF135P52742 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF135P52742 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms