Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GTF2A2P52657 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GTF2A2P52657 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GTF2A2P52657 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GTF2A2P52657 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GTF2A2P52657 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GTF2A2P52657 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GTF2A2P52657 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GTF2A2P52657 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GTF2A2P52657 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GTF2A2P52657 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GTF2A2P52657 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GTF2A2P52657 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GTF2A2P52657 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GTF2A2P52657 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GTF2A2P52657 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
GTF2A2P52657 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
GTF2A2P52657 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GTF2A2P52657 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GTF2A2P52657 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GTF2A2P52657 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GTF2A2P52657 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GTF2A2P52657 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GTF2A2P52657 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GTF2A2P52657 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GTF2A2P52657 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GTF2A2P52657 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
GTF2A2P52657 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
GTF2A2P52657 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GTF2A2P52657 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
GTF2A2P52657 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GTF2A2P52657 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
GTF2A2P52657 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GTF2A2P52657 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GTF2A2P52657 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
GTF2A2P52657 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GTF2A2P52657 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GTF2A2P52657 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GTF2A2P52657 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GTF2A2P52657 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GTF2A2P52657 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GTF2A2P52657 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GTF2A2P52657 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
GTF2A2P52657 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GTF2A2P52657 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GTF2A2P52657 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GTF2A2P52657 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GTF2A2P52657 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GTF2A2P52657 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GTF2A2P52657 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GTF2A2P52657 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GTF2A2P52657 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
GTF2A2P52657 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GTF2A2P52657 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
GTF2A2P52657 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GTF2A2P52657 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GTF2A2P52657 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GTF2A2P52657 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GTF2A2P52657 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GTF2A2P52657 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GTF2A2P52657 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GTF2A2P52657 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GTF2A2P52657 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GTF2A2P52657 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GTF2A2P52657 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GTF2A2P52657 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GTF2A2P52657 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
GTF2A2P52657 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30■■■□□ 2.39
GTF2A2P52657 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30■■■□□ 2.39
GTF2A2P52657 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
GTF2A2P52657 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GTF2A2P52657 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GTF2A2P52657 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
GTF2A2P52657 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
GTF2A2P52657 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GTF2A2P52657 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
GTF2A2P52657 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GTF2A2P52657 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GTF2A2P52657 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GTF2A2P52657 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
GTF2A2P52657 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GTF2A2P52657 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GTF2A2P52657 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GTF2A2P52657 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GTF2A2P52657 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GTF2A2P52657 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GTF2A2P52657 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GTF2A2P52657 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GTF2A2P52657 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GTF2A2P52657 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GTF2A2P52657 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
GTF2A2P52657 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
GTF2A2P52657 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GTF2A2P52657 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GTF2A2P52657 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GTF2A2P52657 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GTF2A2P52657 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GTF2A2P52657 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GTF2A2P52657 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GTF2A2P52657 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms