Protein–RNA interactions for Protein: P51817

PRKX, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit PRKX, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKXP51817 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKXP51817 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKXP51817 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKXP51817 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKXP51817 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKXP51817 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKXP51817 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKXP51817 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKXP51817 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKXP51817 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKXP51817 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKXP51817 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKXP51817 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKXP51817 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKXP51817 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKXP51817 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKXP51817 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKXP51817 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKXP51817 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKXP51817 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKXP51817 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKXP51817 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKXP51817 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKXP51817 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKXP51817 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKXP51817 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKXP51817 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKXP51817 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKXP51817 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKXP51817 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKXP51817 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKXP51817 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKXP51817 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKXP51817 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKXP51817 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKXP51817 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKXP51817 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKXP51817 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKXP51817 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKXP51817 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKXP51817 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKXP51817 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKXP51817 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKXP51817 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKXP51817 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKXP51817 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKXP51817 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKXP51817 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKXP51817 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKXP51817 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKXP51817 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKXP51817 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKXP51817 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKXP51817 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKXP51817 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKXP51817 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKXP51817 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKXP51817 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKXP51817 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKXP51817 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKXP51817 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKXP51817 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKXP51817 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKXP51817 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKXP51817 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKXP51817 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKXP51817 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKXP51817 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKXP51817 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKXP51817 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKXP51817 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKXP51817 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKXP51817 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKXP51817 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKXP51817 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKXP51817 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKXP51817 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKXP51817 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKXP51817 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKXP51817 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKXP51817 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKXP51817 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKXP51817 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKXP51817 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKXP51817 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKXP51817 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKXP51817 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKXP51817 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKXP51817 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKXP51817 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKXP51817 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKXP51817 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKXP51817 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKXP51817 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKXP51817 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKXP51817 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKXP51817 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKXP51817 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKXP51817 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKXP51817 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms