Protein–RNA interactions for Protein: P51610

HCFC1, Host cell factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC1P51610 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HCFC1P51610 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCFC1P51610 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCFC1P51610 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCFC1P51610 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCFC1P51610 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCFC1P51610 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCFC1P51610 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HCFC1P51610 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCFC1P51610 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCFC1P51610 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCFC1P51610 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HCFC1P51610 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCFC1P51610 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCFC1P51610 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCFC1P51610 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCFC1P51610 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCFC1P51610 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCFC1P51610 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HCFC1P51610 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCFC1P51610 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCFC1P51610 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HCFC1P51610 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HCFC1P51610 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HCFC1P51610 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCFC1P51610 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCFC1P51610 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCFC1P51610 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCFC1P51610 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCFC1P51610 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCFC1P51610 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCFC1P51610 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCFC1P51610 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCFC1P51610 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HCFC1P51610 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCFC1P51610 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCFC1P51610 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCFC1P51610 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCFC1P51610 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCFC1P51610 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HCFC1P51610 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCFC1P51610 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCFC1P51610 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HCFC1P51610 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HCFC1P51610 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HCFC1P51610 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HCFC1P51610 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HCFC1P51610 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HCFC1P51610 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HCFC1P51610 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HCFC1P51610 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HCFC1P51610 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HCFC1P51610 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HCFC1P51610 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HCFC1P51610 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HCFC1P51610 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HCFC1P51610 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HCFC1P51610 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HCFC1P51610 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HCFC1P51610 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HCFC1P51610 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HCFC1P51610 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HCFC1P51610 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HCFC1P51610 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HCFC1P51610 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HCFC1P51610 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HCFC1P51610 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HCFC1P51610 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HCFC1P51610 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HCFC1P51610 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HCFC1P51610 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
HCFC1P51610 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HCFC1P51610 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HCFC1P51610 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HCFC1P51610 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HCFC1P51610 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HCFC1P51610 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HCFC1P51610 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HCFC1P51610 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HCFC1P51610 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HCFC1P51610 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HCFC1P51610 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HCFC1P51610 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HCFC1P51610 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HCFC1P51610 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HCFC1P51610 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HCFC1P51610 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HCFC1P51610 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HCFC1P51610 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HCFC1P51610 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HCFC1P51610 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HCFC1P51610 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HCFC1P51610 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HCFC1P51610 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HCFC1P51610 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HCFC1P51610 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HCFC1P51610 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HCFC1P51610 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HCFC1P51610 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HCFC1P51610 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms