Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRCA2P51587 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRCA2P51587 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRCA2P51587 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRCA2P51587 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRCA2P51587 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRCA2P51587 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BRCA2P51587 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BRCA2P51587 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BRCA2P51587 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BRCA2P51587 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BRCA2P51587 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BRCA2P51587 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BRCA2P51587 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BRCA2P51587 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BRCA2P51587 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BRCA2P51587 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRCA2P51587 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRCA2P51587 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRCA2P51587 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRCA2P51587 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRCA2P51587 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRCA2P51587 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BRCA2P51587 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BRCA2P51587 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BRCA2P51587 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BRCA2P51587 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BRCA2P51587 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BRCA2P51587 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
BRCA2P51587 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BRCA2P51587 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRCA2P51587 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRCA2P51587 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRCA2P51587 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRCA2P51587 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRCA2P51587 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRCA2P51587 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
BRCA2P51587 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BRCA2P51587 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BRCA2P51587 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BRCA2P51587 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BRCA2P51587 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BRCA2P51587 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BRCA2P51587 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BRCA2P51587 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BRCA2P51587 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRCA2P51587 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRCA2P51587 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRCA2P51587 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRCA2P51587 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRCA2P51587 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRCA2P51587 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRCA2P51587 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
BRCA2P51587 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BRCA2P51587 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BRCA2P51587 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BRCA2P51587 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BRCA2P51587 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BRCA2P51587 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRCA2P51587 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRCA2P51587 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
BRCA2P51587 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRCA2P51587 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRCA2P51587 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRCA2P51587 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRCA2P51587 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRCA2P51587 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
BRCA2P51587 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRCA2P51587 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRCA2P51587 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRCA2P51587 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRCA2P51587 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRCA2P51587 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRCA2P51587 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRCA2P51587 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRCA2P51587 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRCA2P51587 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRCA2P51587 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRCA2P51587 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRCA2P51587 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRCA2P51587 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRCA2P51587 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRCA2P51587 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRCA2P51587 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
BRCA2P51587 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRCA2P51587 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRCA2P51587 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRCA2P51587 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
BRCA2P51587 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
BRCA2P51587 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRCA2P51587 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRCA2P51587 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRCA2P51587 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRCA2P51587 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRCA2P51587 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
BRCA2P51587 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRCA2P51587 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRCA2P51587 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRCA2P51587 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRCA2P51587 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms