Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAB27AP51159 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB27AP51159 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB27AP51159 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB27AP51159 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB27AP51159 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB27AP51159 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB27AP51159 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB27AP51159 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB27AP51159 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB27AP51159 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB27AP51159 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB27AP51159 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB27AP51159 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB27AP51159 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB27AP51159 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB27AP51159 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB27AP51159 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB27AP51159 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAB27AP51159 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAB27AP51159 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAB27AP51159 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAB27AP51159 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAB27AP51159 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB27AP51159 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB27AP51159 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB27AP51159 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB27AP51159 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB27AP51159 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB27AP51159 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB27AP51159 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB27AP51159 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RAB27AP51159 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RAB27AP51159 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAB27AP51159 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAB27AP51159 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAB27AP51159 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB27AP51159 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB27AP51159 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB27AP51159 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB27AP51159 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB27AP51159 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB27AP51159 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB27AP51159 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB27AP51159 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB27AP51159 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB27AP51159 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB27AP51159 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB27AP51159 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB27AP51159 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAB27AP51159 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RAB27AP51159 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RAB27AP51159 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RAB27AP51159 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB27AP51159 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB27AP51159 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB27AP51159 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB27AP51159 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB27AP51159 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB27AP51159 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB27AP51159 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB27AP51159 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB27AP51159 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB27AP51159 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB27AP51159 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB27AP51159 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB27AP51159 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB27AP51159 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB27AP51159 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB27AP51159 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB27AP51159 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB27AP51159 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB27AP51159 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB27AP51159 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB27AP51159 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB27AP51159 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB27AP51159 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB27AP51159 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB27AP51159 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB27AP51159 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB27AP51159 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB27AP51159 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB27AP51159 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB27AP51159 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB27AP51159 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB27AP51159 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB27AP51159 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB27AP51159 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB27AP51159 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB27AP51159 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB27AP51159 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB27AP51159 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB27AP51159 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB27AP51159 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB27AP51159 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB27AP51159 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB27AP51159 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB27AP51159 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB27AP51159 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB27AP51159 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms