Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Defa6P50704 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Defa6P50704 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa6P50704 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa6P50704 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa6P50704 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa6P50704 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa6P50704 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa6P50704 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa6P50704 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa6P50704 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa6P50704 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa6P50704 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa6P50704 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa6P50704 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa6P50704 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa6P50704 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa6P50704 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa6P50704 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa6P50704 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa6P50704 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa6P50704 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa6P50704 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa6P50704 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa6P50704 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa6P50704 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa6P50704 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa6P50704 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa6P50704 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa6P50704 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa6P50704 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa6P50704 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa6P50704 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa6P50704 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa6P50704 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Defa6P50704 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa6P50704 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa6P50704 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa6P50704 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa6P50704 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa6P50704 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa6P50704 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa6P50704 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa6P50704 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa6P50704 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa6P50704 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa6P50704 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa6P50704 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa6P50704 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa6P50704 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa6P50704 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa6P50704 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa6P50704 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa6P50704 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa6P50704 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa6P50704 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa6P50704 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa6P50704 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa6P50704 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa6P50704 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa6P50704 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa6P50704 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa6P50704 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa6P50704 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa6P50704 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa6P50704 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa6P50704 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa6P50704 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa6P50704 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa6P50704 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa6P50704 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa6P50704 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa6P50704 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa6P50704 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa6P50704 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa6P50704 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa6P50704 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa6P50704 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa6P50704 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa6P50704 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa6P50704 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa6P50704 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa6P50704 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa6P50704 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa6P50704 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa6P50704 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa6P50704 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa6P50704 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa6P50704 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa6P50704 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa6P50704 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa6P50704 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa6P50704 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa6P50704 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa6P50704 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa6P50704 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa6P50704 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa6P50704 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa6P50704 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa6P50704 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms