Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt6aP50446 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt6aP50446 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt6aP50446 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt6aP50446 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt6aP50446 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt6aP50446 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt6aP50446 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt6aP50446 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt6aP50446 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt6aP50446 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt6aP50446 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt6aP50446 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt6aP50446 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt6aP50446 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt6aP50446 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt6aP50446 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt6aP50446 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt6aP50446 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt6aP50446 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt6aP50446 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt6aP50446 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt6aP50446 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt6aP50446 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt6aP50446 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt6aP50446 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt6aP50446 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt6aP50446 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt6aP50446 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt6aP50446 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt6aP50446 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt6aP50446 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt6aP50446 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt6aP50446 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt6aP50446 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt6aP50446 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt6aP50446 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt6aP50446 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt6aP50446 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt6aP50446 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt6aP50446 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt6aP50446 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt6aP50446 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt6aP50446 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt6aP50446 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt6aP50446 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt6aP50446 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt6aP50446 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt6aP50446 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt6aP50446 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt6aP50446 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt6aP50446 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt6aP50446 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt6aP50446 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt6aP50446 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt6aP50446 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt6aP50446 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt6aP50446 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt6aP50446 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt6aP50446 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt6aP50446 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt6aP50446 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt6aP50446 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt6aP50446 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt6aP50446 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt6aP50446 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt6aP50446 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt6aP50446 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt6aP50446 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt6aP50446 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt6aP50446 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt6aP50446 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt6aP50446 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt6aP50446 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt6aP50446 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt6aP50446 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt6aP50446 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt6aP50446 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt6aP50446 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt6aP50446 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt6aP50446 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt6aP50446 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt6aP50446 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt6aP50446 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt6aP50446 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt6aP50446 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt6aP50446 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt6aP50446 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt6aP50446 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt6aP50446 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt6aP50446 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt6aP50446 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt6aP50446 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt6aP50446 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt6aP50446 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt6aP50446 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt6aP50446 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt6aP50446 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt6aP50446 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt6aP50446 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms