Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MRE11P49959 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MRE11P49959 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MRE11P49959 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
MRE11P49959 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MRE11P49959 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MRE11P49959 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
MRE11P49959 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MRE11P49959 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MRE11P49959 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MRE11P49959 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MRE11P49959 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
MRE11P49959 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MRE11P49959 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MRE11P49959 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MRE11P49959 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
MRE11P49959 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MRE11P49959 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MRE11P49959 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MRE11P49959 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MRE11P49959 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MRE11P49959 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MRE11P49959 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MRE11P49959 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MRE11P49959 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MRE11P49959 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MRE11P49959 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MRE11P49959 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MRE11P49959 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MRE11P49959 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MRE11P49959 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MRE11P49959 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MRE11P49959 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MRE11P49959 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MRE11P49959 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MRE11P49959 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MRE11P49959 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MRE11P49959 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MRE11P49959 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MRE11P49959 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MRE11P49959 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MRE11P49959 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
MRE11P49959 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MRE11P49959 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MRE11P49959 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MRE11P49959 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MRE11P49959 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MRE11P49959 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MRE11P49959 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MRE11P49959 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MRE11P49959 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MRE11P49959 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MRE11P49959 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MRE11P49959 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MRE11P49959 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MRE11P49959 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MRE11P49959 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MRE11P49959 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MRE11P49959 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MRE11P49959 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MRE11P49959 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MRE11P49959 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MRE11P49959 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MRE11P49959 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MRE11P49959 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MRE11P49959 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
MRE11P49959 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
MRE11P49959 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
MRE11P49959 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
MRE11P49959 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MRE11P49959 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MRE11P49959 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MRE11P49959 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MRE11P49959 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
MRE11P49959 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MRE11P49959 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MRE11P49959 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MRE11P49959 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MRE11P49959 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MRE11P49959 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MRE11P49959 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MRE11P49959 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MRE11P49959 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MRE11P49959 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MRE11P49959 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MRE11P49959 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MRE11P49959 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
MRE11P49959 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
MRE11P49959 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MRE11P49959 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MRE11P49959 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MRE11P49959 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MRE11P49959 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MRE11P49959 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
MRE11P49959 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MRE11P49959 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MRE11P49959 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
MRE11P49959 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MRE11P49959 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MRE11P49959 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms