Protein–RNA interactions for Protein: P49840

GSK3A, Glycogen synthase kinase-3 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3AP49840 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSK3AP49840 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GSK3AP49840 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSK3AP49840 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSK3AP49840 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSK3AP49840 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSK3AP49840 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSK3AP49840 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSK3AP49840 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSK3AP49840 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSK3AP49840 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSK3AP49840 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSK3AP49840 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSK3AP49840 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSK3AP49840 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSK3AP49840 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSK3AP49840 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSK3AP49840 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSK3AP49840 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSK3AP49840 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSK3AP49840 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GSK3AP49840 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSK3AP49840 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSK3AP49840 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSK3AP49840 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSK3AP49840 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSK3AP49840 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GSK3AP49840 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSK3AP49840 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSK3AP49840 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSK3AP49840 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSK3AP49840 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSK3AP49840 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSK3AP49840 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSK3AP49840 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSK3AP49840 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSK3AP49840 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSK3AP49840 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSK3AP49840 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSK3AP49840 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GSK3AP49840 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSK3AP49840 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GSK3AP49840 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSK3AP49840 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSK3AP49840 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSK3AP49840 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSK3AP49840 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GSK3AP49840 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GSK3AP49840 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GSK3AP49840 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSK3AP49840 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms