Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psen1P49769 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psen1P49769 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psen1P49769 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psen1P49769 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psen1P49769 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psen1P49769 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psen1P49769 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psen1P49769 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psen1P49769 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psen1P49769 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psen1P49769 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psen1P49769 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psen1P49769 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psen1P49769 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psen1P49769 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psen1P49769 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psen1P49769 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psen1P49769 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Psen1P49769 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psen1P49769 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psen1P49769 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Psen1P49769 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Psen1P49769 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psen1P49769 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psen1P49769 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psen1P49769 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psen1P49769 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psen1P49769 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psen1P49769 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Psen1P49769 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psen1P49769 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psen1P49769 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Psen1P49769 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psen1P49769 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Psen1P49769 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psen1P49769 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psen1P49769 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psen1P49769 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psen1P49769 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psen1P49769 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psen1P49769 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psen1P49769 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Psen1P49769 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psen1P49769 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psen1P49769 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psen1P49769 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psen1P49769 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Psen1P49769 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psen1P49769 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psen1P49769 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psen1P49769 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psen1P49769 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psen1P49769 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Psen1P49769 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psen1P49769 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psen1P49769 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psen1P49769 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psen1P49769 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psen1P49769 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psen1P49769 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Psen1P49769 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psen1P49769 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psen1P49769 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psen1P49769 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psen1P49769 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psen1P49769 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psen1P49769 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psen1P49769 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psen1P49769 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psen1P49769 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psen1P49769 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psen1P49769 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psen1P49769 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psen1P49769 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psen1P49769 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Psen1P49769 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Psen1P49769 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psen1P49769 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psen1P49769 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psen1P49769 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psen1P49769 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psen1P49769 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psen1P49769 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psen1P49769 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psen1P49769 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psen1P49769 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psen1P49769 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psen1P49769 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psen1P49769 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psen1P49769 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psen1P49769 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psen1P49769 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psen1P49769 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psen1P49769 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psen1P49769 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psen1P49769 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psen1P49769 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psen1P49769 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Psen1P49769 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms