Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA1P49639 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA1P49639 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA1P49639 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA1P49639 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA1P49639 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA1P49639 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA1P49639 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA1P49639 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA1P49639 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA1P49639 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA1P49639 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA1P49639 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA1P49639 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA1P49639 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA1P49639 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA1P49639 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA1P49639 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA1P49639 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA1P49639 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA1P49639 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA1P49639 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA1P49639 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA1P49639 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA1P49639 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA1P49639 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA1P49639 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA1P49639 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA1P49639 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA1P49639 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXA1P49639 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXA1P49639 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXA1P49639 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA1P49639 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA1P49639 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA1P49639 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA1P49639 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA1P49639 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA1P49639 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA1P49639 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA1P49639 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA1P49639 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA1P49639 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA1P49639 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA1P49639 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA1P49639 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA1P49639 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA1P49639 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA1P49639 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA1P49639 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA1P49639 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA1P49639 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA1P49639 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA1P49639 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA1P49639 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA1P49639 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA1P49639 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA1P49639 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA1P49639 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA1P49639 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA1P49639 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA1P49639 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXA1P49639 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXA1P49639 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA1P49639 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA1P49639 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA1P49639 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA1P49639 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA1P49639 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA1P49639 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA1P49639 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA1P49639 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA1P49639 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA1P49639 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA1P49639 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA1P49639 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA1P49639 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA1P49639 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA1P49639 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA1P49639 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA1P49639 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA1P49639 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA1P49639 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA1P49639 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA1P49639 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA1P49639 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA1P49639 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA1P49639 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA1P49639 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HOXA1P49639 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA1P49639 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA1P49639 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA1P49639 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA1P49639 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA1P49639 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA1P49639 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA1P49639 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA1P49639 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA1P49639 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA1P49639 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms