Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rbp3P49194 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rbp3P49194 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rbp3P49194 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Rbp3P49194 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rbp3P49194 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Rbp3P49194 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rbp3P49194 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rbp3P49194 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rbp3P49194 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rbp3P49194 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rbp3P49194 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rbp3P49194 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rbp3P49194 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rbp3P49194 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Rbp3P49194 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rbp3P49194 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rbp3P49194 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rbp3P49194 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rbp3P49194 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Rbp3P49194 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rbp3P49194 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Rbp3P49194 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rbp3P49194 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rbp3P49194 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rbp3P49194 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Rbp3P49194 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rbp3P49194 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rbp3P49194 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Rbp3P49194 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Rbp3P49194 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rbp3P49194 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rbp3P49194 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rbp3P49194 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rbp3P49194 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Rbp3P49194 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rbp3P49194 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rbp3P49194 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rbp3P49194 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rbp3P49194 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rbp3P49194 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rbp3P49194 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rbp3P49194 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rbp3P49194 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rbp3P49194 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rbp3P49194 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Rbp3P49194 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rbp3P49194 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Rbp3P49194 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Rbp3P49194 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rbp3P49194 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rbp3P49194 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Rbp3P49194 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Rbp3P49194 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rbp3P49194 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rbp3P49194 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rbp3P49194 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rbp3P49194 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rbp3P49194 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rbp3P49194 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rbp3P49194 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Rbp3P49194 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rbp3P49194 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rbp3P49194 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rbp3P49194 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rbp3P49194 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rbp3P49194 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rbp3P49194 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rbp3P49194 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rbp3P49194 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rbp3P49194 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rbp3P49194 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rbp3P49194 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rbp3P49194 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rbp3P49194 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rbp3P49194 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rbp3P49194 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rbp3P49194 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Rbp3P49194 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rbp3P49194 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Rbp3P49194 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rbp3P49194 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rbp3P49194 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rbp3P49194 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rbp3P49194 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rbp3P49194 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rbp3P49194 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Rbp3P49194 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rbp3P49194 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rbp3P49194 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Rbp3P49194 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Rbp3P49194 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rbp3P49194 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rbp3P49194 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rbp3P49194 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rbp3P49194 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rbp3P49194 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rbp3P49194 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Rbp3P49194 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rbp3P49194 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms