Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PXNP49023 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PXNP49023 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PXNP49023 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PXNP49023 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PXNP49023 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PXNP49023 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PXNP49023 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PXNP49023 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PXNP49023 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PXNP49023 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PXNP49023 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PXNP49023 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PXNP49023 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PXNP49023 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PXNP49023 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PXNP49023 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PXNP49023 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PXNP49023 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PXNP49023 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PXNP49023 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PXNP49023 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PXNP49023 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PXNP49023 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PXNP49023 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PXNP49023 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PXNP49023 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PXNP49023 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PXNP49023 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PXNP49023 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PXNP49023 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PXNP49023 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PXNP49023 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PXNP49023 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PXNP49023 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PXNP49023 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PXNP49023 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PXNP49023 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PXNP49023 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PXNP49023 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PXNP49023 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PXNP49023 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PXNP49023 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PXNP49023 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PXNP49023 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PXNP49023 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PXNP49023 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PXNP49023 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PXNP49023 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PXNP49023 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PXNP49023 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PXNP49023 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PXNP49023 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PXNP49023 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PXNP49023 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PXNP49023 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PXNP49023 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PXNP49023 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PXNP49023 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PXNP49023 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PXNP49023 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PXNP49023 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PXNP49023 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PXNP49023 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PXNP49023 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PXNP49023 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PXNP49023 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PXNP49023 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PXNP49023 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PXNP49023 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PXNP49023 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PXNP49023 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PXNP49023 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PXNP49023 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PXNP49023 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PXNP49023 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PXNP49023 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PXNP49023 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PXNP49023 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PXNP49023 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PXNP49023 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PXNP49023 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PXNP49023 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PXNP49023 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PXNP49023 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PXNP49023 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PXNP49023 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PXNP49023 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PXNP49023 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PXNP49023 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PXNP49023 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PXNP49023 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PXNP49023 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PXNP49023 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PXNP49023 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PXNP49023 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PXNP49023 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PXNP49023 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PXNP49023 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PXNP49023 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms