Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Brca1P48754 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Brca1P48754 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Brca1P48754 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Brca1P48754 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Brca1P48754 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Brca1P48754 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Brca1P48754 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Brca1P48754 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Brca1P48754 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Brca1P48754 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Brca1P48754 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Brca1P48754 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Brca1P48754 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Brca1P48754 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Brca1P48754 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Brca1P48754 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Brca1P48754 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Brca1P48754 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Brca1P48754 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Brca1P48754 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Brca1P48754 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Brca1P48754 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Brca1P48754 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Brca1P48754 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Brca1P48754 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Brca1P48754 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Brca1P48754 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Brca1P48754 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Brca1P48754 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Brca1P48754 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Brca1P48754 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Brca1P48754 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Brca1P48754 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Brca1P48754 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Brca1P48754 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Brca1P48754 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Brca1P48754 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Brca1P48754 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Brca1P48754 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Brca1P48754 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Brca1P48754 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Brca1P48754 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Brca1P48754 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Brca1P48754 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Brca1P48754 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Brca1P48754 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Brca1P48754 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Brca1P48754 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Brca1P48754 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Brca1P48754 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Brca1P48754 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Brca1P48754 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Brca1P48754 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Brca1P48754 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Brca1P48754 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Brca1P48754 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Brca1P48754 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Brca1P48754 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Brca1P48754 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Brca1P48754 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Brca1P48754 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Brca1P48754 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Brca1P48754 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Brca1P48754 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Brca1P48754 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Brca1P48754 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Brca1P48754 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Brca1P48754 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Brca1P48754 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Brca1P48754 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Brca1P48754 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Brca1P48754 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Brca1P48754 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Brca1P48754 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Brca1P48754 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Brca1P48754 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Brca1P48754 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Brca1P48754 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Brca1P48754 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Brca1P48754 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Brca1P48754 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Brca1P48754 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Brca1P48754 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Brca1P48754 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Brca1P48754 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Brca1P48754 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Brca1P48754 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Brca1P48754 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Brca1P48754 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Brca1P48754 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brca1P48754 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brca1P48754 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brca1P48754 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Brca1P48754 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Brca1P48754 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Brca1P48754 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Brca1P48754 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Brca1P48754 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Brca1P48754 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms