Protein–RNA interactions for Protein: P48723

HSPA13, Heat shock 70 kDa protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA13P48723 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HSPA13P48723 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HSPA13P48723 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HSPA13P48723 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HSPA13P48723 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HSPA13P48723 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSPA13P48723 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSPA13P48723 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSPA13P48723 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSPA13P48723 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSPA13P48723 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HSPA13P48723 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSPA13P48723 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSPA13P48723 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSPA13P48723 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HSPA13P48723 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HSPA13P48723 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HSPA13P48723 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HSPA13P48723 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HSPA13P48723 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HSPA13P48723 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HSPA13P48723 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HSPA13P48723 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HSPA13P48723 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HSPA13P48723 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HSPA13P48723 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HSPA13P48723 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HSPA13P48723 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HSPA13P48723 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HSPA13P48723 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HSPA13P48723 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HSPA13P48723 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HSPA13P48723 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HSPA13P48723 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HSPA13P48723 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HSPA13P48723 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSPA13P48723 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSPA13P48723 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSPA13P48723 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSPA13P48723 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSPA13P48723 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSPA13P48723 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSPA13P48723 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSPA13P48723 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSPA13P48723 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HSPA13P48723 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HSPA13P48723 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HSPA13P48723 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HSPA13P48723 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HSPA13P48723 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HSPA13P48723 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HSPA13P48723 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HSPA13P48723 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HSPA13P48723 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HSPA13P48723 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HSPA13P48723 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HSPA13P48723 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HSPA13P48723 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HSPA13P48723 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HSPA13P48723 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HSPA13P48723 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HSPA13P48723 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HSPA13P48723 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HSPA13P48723 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HSPA13P48723 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HSPA13P48723 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HSPA13P48723 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HSPA13P48723 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HSPA13P48723 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HSPA13P48723 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HSPA13P48723 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HSPA13P48723 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HSPA13P48723 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HSPA13P48723 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HSPA13P48723 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HSPA13P48723 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HSPA13P48723 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HSPA13P48723 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HSPA13P48723 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HSPA13P48723 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HSPA13P48723 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HSPA13P48723 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HSPA13P48723 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HSPA13P48723 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HSPA13P48723 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HSPA13P48723 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HSPA13P48723 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HSPA13P48723 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HSPA13P48723 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HSPA13P48723 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HSPA13P48723 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HSPA13P48723 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HSPA13P48723 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HSPA13P48723 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HSPA13P48723 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HSPA13P48723 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HSPA13P48723 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HSPA13P48723 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HSPA13P48723 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HSPA13P48723 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms